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大肠癌发生中甲基化敏感microRNA的研究
  • 项目名称:大肠癌发生中甲基化敏感microRNA的研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:30900821
  • 申请代码:C060604
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2010-01-01-2012-12-31
  • 项目负责人:唐洁婷
  • 负责人职称:主治医师
  • 依托单位:上海交通大学
  • 批准年度:2009
中文摘要:

非编码小RNA(包括microRNA)介导的改变属于表观遗传学范畴,近期的研究表明,肿瘤发生中伴随miRNA谱表达异常,其调节机制可能与甲基化调控相关,且部分miRNA可能靶定甲基化转移酶。本项目通过高通量芯片筛选、亚硫酸盐修饰后测序、定量PCR等方法筛选和验证大肠癌甲基化敏感的miRNA;并利用荧光素酶报告基因检测试验和Western blot等手段验证软件预测的靶基因。同时,探究miRNAs表观遗传学谱成为结直肠癌诊断和预后判断的分子标志的可能性。另一方面,通过软件预测并验证甲基化敏感miRNA的靶基因,进一步了解甲基化敏感miRNA在靶基因的表观遗传性调节中的作用,为发现大肠癌防治的表观遗传学新切入点做全新的尝试,实现基因组学与肿瘤生物学的整合。

结论摘要:

DNA甲基化水平异常是肿瘤发生过程中抑癌基因沉默的机制之一。人大肠癌(human colorectal cancer,CRC)发生发展过程中,一种非编码微小RNA (microRNAs,miRNAs)的表达谱异常,部分miRNAs可能发挥抑癌基因的作用。在此项研究中,我们探讨了启动子区CpG岛高甲基化是否是引起miRNAs表达异常的机制之一,并筛选和鉴定与CRC发生发展相关的甲基化敏感miRNA。我们用miRNA表达芯片检测去甲基化制剂5氮脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycitidine,5-aza-dC)处理后大肠癌细胞系miRNAs表达谱的变化情况,以初步筛选候选miRNAs。由甲基化特异性PCR(methylation-specific PCR,MSP)和亚硫酸盐处理后基因组测序两种方法检测候选miRNA在大肠癌细胞和组织中的甲基化状态;以实时定量PCR (quantitative real-time PCR, qRT-PCR)技术检测细胞和组织中miRNA表达水平。最后,我们通过荧光素酶报告基因技术、qRT-PCR及western blot方法验证候选miRNA的靶基因。 经5-aza-dC 处理后,mir-345的表达水平显著升高。甲基化分析显示,CRC组织中mir-345 CpG岛甲基化水平显著高于正常人的大肠粘膜组织。与正常非癌组织相比较,51.6% CRC组织低表达mir-345,且表达水平与甲基化水平相关。低表达mir-345的病例淋巴结阳性率较高且病理分化较差。此外,我们验证了BCL2相关永生基因3(BCL2-associated athanogene 3,BAG3)是mir-345的一个靶基因。BAG3是一个凋亡调节因子,我们首次报道了BAG3的表达水平在CRC组织中显著升高,并与肿瘤的浸润深度相关。我们的研究提示,mir-345是CRC的一个新的甲基化敏感miRNA。 CpG岛甲基化引起的mir-345表达异常可能通过下调其靶基因参与CRC的发生发展。

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