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初探罕见染色体拷贝数变异引发精神疾病患病风险的机理
  • 项目名称:初探罕见染色体拷贝数变异引发精神疾病患病风险的机理
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:31000553
  • 申请代码:C060404
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:师咏勇
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:上海交通大学
  • 批准年度:2010
中文摘要:

作为典型的受遗传与环境因素共同影响的复杂疾病,精神分裂症与重性抑郁症患病率高,给患者及其家属带来极大的痛苦。近年来,对精神疾病的多项遗传学研究表明罕见拷贝数变异在患者中的发生频率显著高于正常人,已有多个拷贝数变异位点被证实与精神分裂症等精神疾病相关。我们运用Affymetrix 500k/SNP6.0芯片,多重连接探针扩增法以及定量PCR实验相互验证的策略,也已经发现了一个与中国汉族精神分裂症和重性抑郁症病致病风险相关的罕见拷贝数变异位点,目前亟需对这一拷贝数变异内部的具体结构及其功能深入了解,并尝试解答其致病机理。本项目拟采用新一代高通量测序平台的全基因组末端配对测序方法对携带该罕见拷贝数变异的72个个体进行分析,研究这一拷贝数变异的具体结构,考察这一区域的基因如何受到这个拷贝数变异的影响,筛查出致病基因并分析其致病机理,并探索拷贝数变异发生的机制。

结论摘要:

近年来,对精神疾病的多项遗传学研究表明罕见拷贝数变异在患者中的发生频率显著高于正常人,已有多个拷贝数变异位点被证实与精神分裂症等精神疾病相关。我们前期运用Affymetrix 500k/SNP6.0 芯片,多重连接探针扩增法以及定量PCR 实验相互验证的策略,在15号染色体发现了一个与中国汉族精神分裂症等重性精神疾病致病风险相关的罕见拷贝数变异位点。本项目尝试采用芯片、测序等技术对该罕见拷贝数变异的致病风险、结构和功能进行分析并考察这一区域的基因如何受到这个拷贝数变异的影响,力争阐明其机制。 项目组首先以15号染色体区域罕见染色体拷贝数变异为研究目标,开展了基于二代测序技术的染色体拷贝数结构分析,但未发现拷贝数变异对基因结构的改变,最终得出“候选基因最有可能是由于表达量的改变而非结构改变导致疾病风险”的结论;其次,项目组在研究过程中开发了目标区域单倍型结构实验分析方法以及数据分析方法,为相关领域研究奠定一定的基础。 在项目执行期间,有本项目研究结果直接发表或应用本项目开发的研究方法发表的SCI论文(标注项目号31000553)达17篇,包括以项目负责人为通讯作者/第一作者、发表于Nature Genetics、Nature Nanotechnology、Schizophrenia Bulletin、Plos Genetics等杂志的论文14篇。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 18
  • 0
  • 0
  • 0
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