长链非编码RNA(lncRNA)是一类新发现的长度超过200nt的非编码RNA,通过调控基因的表达参与胚胎发育和组织分化等生命活动过程。lncRNA的异常表达可导致肿瘤的发生和发展,而它们是否可作为标志物用于肿瘤的诊断、特别是它们与胃癌的关系迄今尚未明确。本课题组最近在胃癌组织中发现了一些高表达和低表达的lncRNA,为此,本研究拟采用定量RT-PCR和生物信息学等技术鉴定与胃癌发生密切相关的lncRNA;然后通过基因转染或RNA干扰技术上调或下调胃癌细胞和正常胃黏膜上皮细胞中lncRNA的表达,并结合RNA Pull-down和Western印迹等技术查明lncRNA影响胃癌细胞生长的分子机制;再经裸鼠移植瘤实验明确其对胃癌细胞生长的影响;最后通过比较正常人、良性胃病患者、胃癌前病变患者和胃癌患者血浆中lncRNA的检测率,确定有诊断价值的若干种lncRNA,以提高胃癌的非创性诊断水平。
gastric cancer;tumor;long noncoding RNA;molecular diagnosis;carcinogenesis
长链非编码RNA(lncRNA)是一类新发现的长度超过200核苷酸的不编码或很少编码蛋白质的RNA 分子。近年来研究表明,lncRNA 的异常表达可导致肿瘤的发生,而它们是否可作为标志物用于肿瘤的诊断、特别是它们与胃癌的关系在本课题立项之前尚未明确。本课题的主要内容包括(1)比较胃癌组织和癌旁组织中lncRNA的表达谱,筛选出若干种胃癌相关 lncRNA。(2)上调和下调 lncRNA 在胃癌细胞、正常胃黏膜上皮细胞中的表达,寻找lncRNA 影响胃癌细胞生长的关键分子。(3)在实验动物水平上分析目标lncRNA对胃癌生长的影响及主要机制。(4)比较胃癌患者、胃癌前病变患者、良性胃病患者和正常人血浆中lncRNA的检测情况,确定胃癌相关lncRNA的临床诊断价值。本课题揭示了胃癌相关lncRNA的表达谱,发现在胃癌组织中表达水平较低的lncRNA有FER1L4、uc001lsz、BG491697、AF131784、uc009ycs、BG981369、AF147447、HMlincRNA1600和AK054588,高表达的lncRNA有H19、HMlincRNA717、BM709340、BQ213083、AK054978和DB077273;阐明了3种lncRNA (GACAT3、FER1L4和RMRP)通过靶向miRNA、调控抑癌基因表达和影响细胞周期等机制在胃癌发生、发展中的发挥重要作用;建立了基于血液和胃癌lncRNA实时定量RT-PCR检测的胃癌诊断新方法,确定了7种胃癌相关lncRNA (GACAT1、GACAT2、GACAT3、FER1L4、ABHD11-AS1、LINC00152和AA174084)的临床诊断价值,对于提高胃癌的诊治水平做出重要贡献。有3种lncRNA被国际人类基因组组织(HUGO)正式命名为第1至第3种胃癌相关转录本(gastric cancer associated transcript)——GACAT1、GACAT2、GACAT3;共发表SCI收录论文12篇(其中TOP期刊1篇,ESI高被引论文1篇,SCI 二区4篇,总影响因子47.088),国内一级核心期刊论文3篇,国际会议交流论文3篇,全国性学术会议分组报告2篇,申请发明专利2件,培养研究生4名,学生获第三十届全国青少年科技创新大赛一等奖和“十佳青少年科技创意之星“称号。