作为细菌抵御噬菌体或质粒等外源DNA侵染的免疫系统- - CRISPR,显示了细菌在其生长繁殖环境中的不断进化过程。细菌利用CRISPR系过将外源DNA的部分短片段整合入自身基因组中而获得了免疫能力。由于其在分子分型上具有巨大的潜力,因此本研究期望联合CRISPR序列和毒力基因fimH、sseL的测序分析,建立针对我国家禽中流行的传染性鸡白痢沙门菌的CRISPR-MVLST分型方法,并对本室保存的1962年至今的300多株来源于不同地区的鸡白痢沙门菌进行分子分型,构建细菌CST型进化树,同时通过与本室已建立的传统沙门菌PFGE分型方法进行比较来评价新分型方法的分辨力、CRISPR在细菌分子分型中的应用价值及解释该菌流行病学规律的能力。在此基础上,综合前期对菌株的耐药性分析结果,及PFGE型与细菌耐药表型尚不存在明显的相关性,应用CRISPR-MVLST分型来评价耐药表型与CST型之间的相关性。
英文主题词salmonella;Pullorum disease;CRISPR;molecular typing;antibiotic resistance