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孤独症全基因组关联第二阶段研究
  • 项目名称:孤独症全基因组关联第二阶段研究
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:81071110
  • 申请代码:H0923
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2011-01-01-2013-12-31
  • 项目负责人:王力芳
  • 负责人职称:主治医师
  • 依托单位:北京大学
  • 批准年度:2010
中文摘要:

孤独症是一种起病于婴幼儿期的神经发育障碍。研究提示遗传因素在该病发病中起重要作用。孤独症全基因组关联研究(GWAS)克服了候选基因策略的局限性,有助于从全基因组水平发现新的易感基因。由于种族遗传异质性,亟待开展汉族人群孤独症GWAS研究。本课题组前期已完成汉族孤独症GWAS第一阶段研究,对240个孤独症家系进行了全基因组50万个单核苷酸多态性(SNPs)芯片检测,发现40余个与孤独症关联的SNP位点。本研究将另外收集较大孤独症家系样本,采用与前期工作相同的诊断标准(孤独症诊断访谈量表),降低样本的异质性;继而采用Sequenom MassARRAY等基因型检测方法,对GWAS第一阶段筛选出的具有显著意义的SNP位点进行第二阶段验证;以期发现新的孤独症神经发育相关易感基因,并对易感基因功能进行初步研究。本研究与前期工作密切衔接,预期结果将为孤独症病因与发病机制提供线索。

结论摘要:

本项目采用多种国际通用的诊断标准,并引进相应工具,完成孤独症诊断访谈量表(ADI-R)、孤独症评定量表(CARS)、孤独症行为问题问卷(ABC)的评定,辅以较为完整的各项临床评估。采集儿童孤独症患者血样,以及其父母正常对照的血样,并提取DNA。目前已收集汉族儿童孤独症核心家系800余个,建立孤独症遗传资源库。全基因组关联研究两阶段设计的第一阶段研究,并开展了第二阶段的研究。 在第一阶段的研究中,首先进行了240个家系的全基因组SNP芯片的检验,经过严格的质量控制后,去除1个家系,239个家系纳入统计分析。采用PLINK软件和FBAT进行全基因组以家系为基础的关联研究,发现多个具有显著性意义的SNP位点。在第二阶段研究中,选取P <1E-05的10余个位点在在另外独立样本约569余个孤独症家系中进行全基因组关联研究结果的2期验证,研究发现位于SMARCA2 基因上游的rs3847228 与孤独症关联,而且另外一个位于NRXN3基因的SNP(单核苷酸多态性)位点也与孤独症关联(P<0.05)。SMARCA2 参与染色质的重塑,使其他转录因子结合到DNA上,发挥转录活性,继而启动其他基因的表达。既往研究报道SMARCA2 与精神分裂症关联。SMARCA2 本研究进行了SMARCA2的功能研究,发现干扰SMARCA2 影响神经元迁移。NRXN3是参与突触形成的分子,既往研究发现参与突触形成的分子NLGN3、NLGN4、SHANK3、SHANK2等与孤独症关联,提示孤独症患者可能存在突触的异常。突触是一个神经元与另一个神经元相接触的部位。因此,突触是神经元之间在功能上发生联系的部位,也是信息传递的关键部位。既往研究曾发现NRXN家族中的NRXN1 基因与孤独症关联,但尚未有报道NRXN3 基因与孤独症关联。通路分析也发现,参与神经发育、树突形成的通路与孤独症关联。研究结果已投稿并修回。全基因组关联研究也为易感基因关联研究提供了宝贵的线索。既往研究仅针对RELN基因进行关联分析,尚无DAB1基因与孤独症关联的报道。本课题组进一步针对通路分析发现,RELN通路上的DAB1 基因与孤独症关联。继而以全基因组关联研究为线索,发现DISC1,ATP2B2 是孤独症的易感基因。对ASMT基因测序发现孤独症患者存在罕见突变。共发表论著6篇,其中SCI收录论著5篇。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 7
  • 0
  • 0
  • 0
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