)鲤科是淡水鱼类最大的科,是鱼类系统性适应淡水环境最成功的一个类群,除南北极、南美洲和澳洲外,其他各洲都有分。全世界共有鲤科鱼类2000多种,其中我国有530余种,包括了目前确认的全部12个鲤科鱼类的亚科。DNA条形码是辅助物种识别的一个很好构想,提供了可信息化的分类学标准和有效的分类学手段。鲤科是我国淡水鱼类中的优势类群,在该类群的标本收藏、分类研究和系统发育研究方面已有长期的历史积累。课题将选择中国鲤科鱼类代表性种类进行DNA条形码研究,完善鲤科DNA条形码标准基因系统;基于获得的DNA条形码标准序列构建系统树,并将其与现行分类系统比较来研究鲤科鱼类的进化;通过生物地理信息进行比较,来探讨鲤科鱼类系统发育相关的重要进化事件。课题研究内容包括系统性的样品采集、鉴定、测序和分析;物种不同地理种群的序列比较;数据分析基于数据库。研究结果对生物多样性保保护和水产养殖等领域具有重要意义。
Cyprinid fishes;DNA barcoding;biogeography;DNA barcoding standard gene;
本课题选择鲤科鱼类为研究对象,进行DNA条形码研究,完善鲤科鱼类DNA条形码标准基因系统,为进一步建立鱼类条形码数据库奠定基础。通过对鲤科鱼类DNA条形码序列信息和物种信息的检索、提取和比对分析,并经过有关的论证和实验,为鲤科常见经济鱼类的物种鉴定提供一个标准的基于分子技术平台的工具。基于获得的DNA条形码标准基因序列构建系统树,并将其与现行分类系统比较来研究鲤科鱼类的进化。 从2011年1月至2014年12月,分别赴长江流域、怒江流域、珠江水系及甘肃境内黄河水系、嘉陵江水系和河西内陆河水系采样,共采集鲤形目和鲇形目鱼类样本3328尾。其中,成功扩增鲤科鱼类11亚科52属78种1955尾样本的DNA条形码(COI)序列。分别对珠江水系、怒江流域、长江中下游和甘肃境内黄河流域所采集的鲤科鱼类开展了种间和种下的系统发育研究,完善了鲤科鱼类的DNA条形码的鉴定和查询系统。