鲤科鲃系鱼类中大量物种具有染色体多倍化现象,本项目选择鲤科鲃系鱼类作为研究对象,研究其分子系统发育和染色体多倍化进程。在鲃系鱼类系统发育工作中,我们收集到132种鲤科鱼类标本。以线粒体的16S rRNA 基因、ND4基因、细胞色素b基因序列和核基因的RAG2基因为分子标记,重建了鲃系鱼类的系统发育关系并估计了其主要类群的分化时间。我们的研究结果显示鲃系是一个单系群,其内部存在三个单系群分别是鲤族、野鲮族以及结鱼属和非洲六倍体Barbus属种类组成的单系群。裂腹鱼类不是单系群,可以分为两个分支一支由鲈鲤属和裂腹鱼属组成;另一支则包括特化等级裂腹鱼、高度特化等级裂腹鱼、少鳞舟齿鱼和Barbus barbus。估算出鲃系鱼类最早的分化时间大约20Mya,野鲮类分化时间为15Mya,鲤族鱼类的分化时间为17.9Mya。裂腹鱼类的分化与青藏高原隆起的三个阶段相一致。依据已有的鱼类核型资料记录及我们对裂腹鱼核型分析的结果,我们推导在鲤亚科的分化过程中,至少发生过13次多倍化事件。以Sox和视蛋白基因为模型,研究多倍体中重要功能基因演化的结果显示,这些重复基因具有不同的进化模式。我们构建了平均插入长度为一百二十kb和覆盖度为七点二倍的齐口裂腹鱼的BAC文库。
英文主题词Cyprinidae; phylogenetics; polyploidy; evolution