中文摘要：

应用分子生物学技术（特定的线粒体DNA、核DNA序列及DNA条形码技术）与传统形态学分类方法比对分析，修正形态分类学的某些失误，在分子水平上构建仿石鲈科及有争议的相关科属(鯻科、眶棘鲈科、金线鱼科)共同的系统发育关系，并与形态特征对应分析，判别出相应属种在形态分类依据上的缺陷，找出主成份分类特征，使形态分类结果与分子水平的系统关系一致。同时，构建我国仿石鲈科鱼类DNA条码数据库，完善我国仿石鲈科鱼类相关的物种信息。最终提供我国仿石鲈科鱼类物种详细信息及其科属种隶属关系最科学的系统发育分析方法及其研究成果，并提供形态鉴别的主成份依据作为种类鉴定的主要指标。本项目研究成果对厘定仿石鲈科鱼类的分类地位及其系统发育关系、揭示传统形态分类与现代分子分类的耦合规律有重要意义，对其它鱼类分类及系统发育的研究提供可借鉴的思路。

结论摘要：

本项目按原计划采集并获得了我国近海仿石鲈科、眶棘鲈科、金线鱼科和鯻科的代表性种类。并通过与国外专家的交流获得了大量分布于非洲、北美洲、大洋洲等我国海域没有记录的仿石鲈科鱼类的珍贵样品，极大丰富了项目研究内容。本研究成功获得了广义仿石鲈科鱼类线粒体DNA（mtDNA）的16S、Cytb、COⅠ序列和核DNA的S7、RAG2、TMO-4C4序列以及各物种相对应的DNA条码标准基因序列，基于所得分子标记序列进行了分子系统进化分析，澄清了眶棘鲈科和鯻科的分类归属问题；此外，根据丰富的样品种类我们对仿石鲈科内部胡椒鲷属、少棘胡椒鲷属和髭鲷属之间物种聚类关系及进化地位结合形态学分类数据进行了深入的分析。在GenBank上登录和公布了我国仿石鲈科所有鱼类的mtDNA的16S、Cytb、COⅠ序列和核DNA的S7、RAG2、TMO-4C4序列以及各物种DNA条码标准数据；阐述了核DNA的S7、RAG2、TMO-4C4序列对鱼类系统发育分析的意义，为我国将来的广泛应用打下了一定的基础。目前已发表4篇国际SCI论文、4篇国内核心学报论文（另有多篇论文已投稿或准备投稿），培养博士研究生与硕士研究生各1名。