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非可控性炎症条件下正常胃上皮细胞向肠上皮化生恶性转化的精确动态转录因子调控网络研究
  • 项目名称:非可控性炎症条件下正常胃上皮细胞向肠上皮化生恶性转化的精确动态转录因子调控网络研究
  • 项目类别:重大研究计划
  • 批准号:91229108
  • 申请代码:C0505
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2013-01-01-2015-12-31
  • 项目负责人:郭妍
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:上海交通大学
  • 批准年度:2012
中文摘要:

在幽门螺杆菌感染引起的非可控性炎症条件下,胃正常上皮细胞向肠上皮化生转化是肠型胃癌发生的第一次不可逆的细胞恶性转化,但是细胞恶性转化的机制尚不清楚。本项目利用精细动态转录因子调控网络构建的新方法,结合激光显微切割分选技术,deepCAGE技术和第二代高通量测序技术,对同一肠型胃癌组织中正常胃上皮细胞和不同恶性程度的肠上皮化生,对mRNA 5’末端的20个碱基进行高通量测序,获得单碱基分辨的转录起始位点信息和启动子使用情况,结合已知的转录因子位点和位置权重矩阵,在全基因组的尺度分析转录因子在细胞转化过程中的活性和相关性,构建高质量的精细动态转录因子调控网络,寻找肠上皮化生发生的关键因素和重要的网络节点,将为肠型胃癌的早期防治提供策略,同时为其它类型的炎症-肿瘤转化机制研究提供线索,所建立的技术显然也适用于其他类型细胞恶性转化的转录因子调控网络研究。

结论摘要:

英文主题词intestinal metaplasia;gastric cancer;genomic instability;transcription start site;microsatellite


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
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  • 著作
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