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基于配体-靶标蛋白相互作用的靶向库设计方法发展及其在药物发现中的应用
  • 项目名称:基于配体-靶标蛋白相互作用的靶向库设计方法发展及其在药物发现中的应用
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30672539
  • 申请代码:H3007
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2007-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:蒋华良
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国科学院上海药物研究所
  • 批准年度:2006
中文摘要:

本项目发展了同时考虑蛋白质和小分子柔性的分子对接方法InduFitDock;建立了多尺度分子对接优化模型和算法;发展了基于多目标优化的分子对接程序;完成基于知识的分子对接打分函数KScore;发展了一种简单的蛋白质折叠能量势函数;发展了多目标方法进行小分子构象生成程序;开发了一种基于药效团匹配及分子对接的虚拟筛选程序;发展了基于药效团匹配的药物及靶标预测发现系统;发展了毒性预测方法;发展了基于碎片的药物设计方法;发展基于遗传算法的化合物组合优化程序。开展HIV-1整合酶、PLK1等抑制剂研究,获得多个活性化合物。其中对HIV-1整合酶活性最好的DC032目前已进入临床前研究。发现Aristolactam AIIIa可以同时结合Plk1的KD和PBD功能结构域,而且是通过增强它们之间的相互作用来实现对Plk1活性的抑制。综合运用了集中组合库设计、化学合成以及生物测试等药物发现策略,对 HpFabZ酶抑制剂进行优化,在设计、合成的 12个小分子中,大多数的化合物显示了中等甚至较强的HpFabZ酶的抑制活性,其中活性最强的化合物的IC50值达到了0.86微摩尔,较先导化合物活性提高了46倍。

结论摘要:

英文主题词Drug Design; Target-Focused Library; Combinatorial Library; Anti-HIV Drug; Anti-Cancer Drug


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 15
  • 0
  • 0
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