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采用基因芯片技术研究垂体ACTH腺瘤的基因表达
  • 项目名称:采用基因芯片技术研究垂体ACTH腺瘤的基因表达
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:30872651
  • 申请代码:H1618
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2009-12-31
  • 项目负责人:张亚卓
  • 负责人职称:教授
  • 依托单位:北京市神经外科研究所
  • 批准年度:2008
中文摘要:

本研究应用光纤微珠芯片筛选ACTH腺瘤与正常垂体组织的差异基因表达谱,应用实时荧光定量PCR对芯片结果进行验证,应用R语言和Bioconductor package对差异基因表达谱进行Gene Ontology (GO)及Pathway分析。本研究鉴定出可能在ACTH腺瘤的发生、发展中起重要作用的候选基因是HIGD1B、EPS8、HLA-A29.1、CGB5、TSHB、HPGD、DAPK2和IGFBP3。通过Go分析发现在细胞成分中基因主要富集于细胞,其次是细胞外区域;在分子功能中基因主要富集于结合、催化活性和分子转导活性;在生命过程中基因主要富集于细胞过程、生物调节及发育过程;通过Pathway分析发现差异显著、可能在肿瘤发生、发展中起重要作用的通路有细胞外基质-受体相互作用通路、转化因子β通路、WNT通路和维生素A代谢通路。本研究表明光纤微珠芯片在鉴定涉及肿瘤发病机理的基因方面是个有用的方法,而对基因表达谱进行GO及PATHWAY分析,则对进一步揭示肿瘤的发病机理起着至关重要的作用,同时本研究鉴定出的新的候选基因及通路,对进一步研究ACTH腺瘤的发病机理和治疗提供了依据。

结论摘要:

英文主题词Pituitary adenoma; ACTH adenoma; Fiber-Optic BeadArray; GO analysis; Pathway analysis


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