研究中国水生植物区系组成、性质、特点及起源;分析环境梯度(三级阶地地貌类型)对水生植物垂直分布格局及气候因子(不同气候带)对水生植物纬向(水平)分布格局的影响;探讨水生植物现代分布中心、分布格局及其成因,中国水生植物的适应辐射和散布途径,对中国水生植物进行区划;研究中国水生植物区系与周邻国家水生植物区系的关系;分析水体富营养化、水位波动、生境分割、围湖造田、渔业利用和资源限制对水生植物生长发育和多样性的影响;阐明中国水生植物的受危现状并划分濒危等级,提出特有和濒危水生植物的保护和原始水域生态系统的维持措施;归纳重要水生植物分类群的性状分化和地理分异规律。为中国水生植物的利用和多样性保护提供理论依据,为《中国水生植物志》编写提供准确详实的资料。