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影响水稻幼苗生长的激素互作网络研究和植物激素相关数据整合平台的建立
  • 项目名称:影响水稻幼苗生长的激素互作网络研究和植物激素相关数据整合平台的建立
  • 项目类别:重大研究计划
  • 批准号:90917016
  • 申请代码:C020408
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2010-01-01-2012-12-31
  • 项目负责人:王秀杰
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国科学院遗传与发育生物学研究所
  • 批准年度:2009
中文摘要:

激素是植物体内合成的一系列天然化合物,在调控植物生命活动的各个方面发挥着至关重要的作用。尽管关于植物激素的研究已经开展了很多年,但以往的研究大多是针对单个激素展开的,对激素间相互作用的研究并不多。越来越多的证据显示不同激素作用途径间存在相互作用,并且这些相互作用直接影响激素的功能。本项目中,我们将采用生物信息学和实验生物学相结合的手段,研究水稻幼苗地上部分中主要激素间的相互作用关系,构建激素互作网络图,并研究这一激素互作网络在不同激素缺失条件下的动态变化情况以及小分子非编码RNA在这一网络中的作用,从而初步阐明水稻幼苗中的激素互作网络关系,并为将来研究水稻其它器官和生长时期中的激素互作网络奠定基础。我们还将构建植物激素研究相关数据的整合与分析平台,从而为从系统生物学的角度研究植物激素功能以及植物激素研究相关数据的保存与共享提供平台。

结论摘要:

激素是植物体内合成的一系列天然化合物,在调控植物生命活动的各个方面发挥着至关重要的作用。关于植物激素研究方面国内外已经取得了很多重要成果,并且获得了一系列植物激素相关的突变体、功能基因、转录组、蛋白质组和代谢组等方面的数据。但目前尚没有统一的平台将这些数据整合起来以便管理与用户查找使用。本项目中,我们收集、整理了国内外发表的植物激素相关突变体、功能基因、转录组等数据,构建了植物激素研究相关数据的整合与分析软件。该软件不仅可以为科学家们提供植物激素相关数据收集与检索的平台,还将包括多种分析功能,使用户可以方便地进行查询数与数据库中数据的比较分析,从而更加有效地利用已发表数据。并且为将来建立准确的植物激素调控的基因表达网络提供数据基础。同时,我们还开发了对植物小分子RNA进行高通量分析的软件psRobot,并参与完成了重要抗盐植物盐芥的基因组测序工作,发现ABA相关基因扩增导致的ABA高表达可能有助于盐芥适应高盐环境。


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
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