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磷酸化肽质谱鉴定中的算法问题研究
  • 项目名称:磷酸化肽质谱鉴定中的算法问题研究
  • 项目类别:青年科学基金项目
  • 批准号:30800189
  • 申请代码:C050201
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2009-01-01-2011-12-31
  • 项目负责人:孙世伟
  • 负责人职称:副研究员
  • 依托单位:中国科学院计算技术研究所
  • 批准年度:2008
中文摘要:

蛋白质磷酸化修饰由于具有调控蛋白质活性和功能的重要作用而受到关注。质谱技术是大规模磷酸化蛋白鉴定主要手段。目前,基于质谱数据的磷酸化蛋白和肽段的专门搜索软件发展的并不完善。课题从蛋白质组水平上研究磷酸化肽大规模鉴定及分析的技术和方法。在肽段及磷酸化肽段的质谱鉴定过程中,主要有两个重要问题,第一是实验谱的噪音处理问题;第二是在鉴定过程中的理论谱生成问题,另外,为了提高准确率,还有多数据融合问题,本课题中,我们分别对这三个问题进行了研究,具体研究实验质谱预处理方法、磷酸化肽的判别分析、磷酸化位点的鉴定等方面的关键问题,建立一套高效可行的磷酸化肽的鉴定方法,开发出一套实用的分析算法和软件,为蛋白质组计划中磷酸化蛋白分析提供有利的技术保障。

结论摘要:

英文主题词mass-spectrometric technique; proteomics;phosphorylated peptides; algorithm;


成果综合统计
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