非特异性核酸酶能非特异性地降解几乎所有形式的核酸,用途广泛。来自小肠肠炎耶尔森菌的非特异性核酸酶,不仅具有非特异性,而且具有热稳定性(100℃加热20min,仍有酶活)及广泛的适用性(超级耐酸碱、耐冷热,耐化学物质),目前国内外没有关于其的相关报道。本项目将首先明确Y.e.p核酸酶的核苷酸序列,然后通过基因工程手段构建Y.e.p核酸酶高产菌株;另外本项目将阐明重组Y.e.p核酸酶的作用机制;分析Y.e.p核酸酶的耐热机制,在此基础上展开Y.e.p核酸酶的功能进化研究,期望为Y.e.p非特异性核酸酶的工业化应用提供理论基础。
non-specific;nuclease;heat resistance;site-directed mutagenesis;
来自小肠肠炎耶尔森菌的核酸酶,不仅具有非特异性,而且具有热稳定性及广泛的适用性,目前国内外没有关于其的相关报道,鉴于其广阔的应用前景和广泛的适用性,本项目对其进行了相关研究。主要内容包括 Y.e.p 非特异性核酸酶高产菌株构建;Y.e.p 非特异性核酸酶酶学性质研究;Y.e.p 非特异性核酸酶的定点突变研究。研究结果如下(1)利用已知Y.e.e非特异性核酸酶基因(YE2923)的侧翼序列,做同源分析及蛋白质序列比对,找到保守序列,设计兼并引物,扩增出Y.e.p非特异性核酸酶片段,从而明确了Y.e.p非特异性核酸酶的核苷酸序列及氨基酸序列;(2)利用大肠杆菌原核表达系统,构建了Y.e.p非特异性核酸酶高产菌株,质粒载体pET24a转入BL21 StarTM(DE3) PlysS表达效果最好;(3)利用单因素及曲面响应法优化诱导条件,最佳条件下蛋白表达量达到 1.5 mg/mL;(4)利用Ni-NTA亲和层析柱纯化获得重组蛋白纯度大于90%;(5)通过对重组Y.e.p核酸酶酶学性质研究,确定了其最适作用温度55 ℃,最适作用pH为7.0,20mM MgCl2作为激活剂;(6)通过稳定性研究确定 MgCl2,BSA,30%及以下浓度的甘油可以作为该重组核酸酶保藏的稳定剂;且该酶的热稳定性及酸碱稳定性相当好,耐各种化学试剂(2-8mMSDS,120 mM EDTA,2-10mM的盐酸胍);(7)对重组核酸酶的作用方式进行了研究,结果表明Y.e.p核酸酶对 dsDNA、ssDNA、λ-DNA、质粒和RNA具有降解效果,且降解率达到100%,说明此酶属于非特异性核酸酶,且同时具有内切和外切的作用方式;(8)通过对Y.e.p核酸酶的定点突变研究发现E202A,I203F,D264E这三个位点的氨基酸改变能引起酶活的变化及热稳定性变化,由此推测Glu202, Ile203 and Asp264可能是影响Y.e.p非特异性核酸酶酶活和热稳定性的关键氨基酸残基;(9)通过对Y.e.p核酸酶活性位点、盐桥和二硫键的定点突变研究,改变活性位点氨基酸、破坏盐桥和二硫键组成,发现Y.e.p非特异性核酸酶的酶活和热稳定性急剧下降,说明活性位点对维持Y.e.p核酸酶的酶活,盐桥和二硫键对维持Y.e.p核酸酶的热稳定性具有重要作用。