位置:立项数据库 > 立项详情页
华贵栉孔扇贝微卫星分子标记开发及连锁图构建
  • 项目名称:华贵栉孔扇贝微卫星分子标记开发及连锁图构建
  • 项目类别:面上项目
  • 批准号:40776088
  • 申请代码:D0609
  • 项目来源:国家自然科学基金
  • 研究期限:2008-01-01-2010-12-31
  • 项目负责人:喻子牛
  • 负责人职称:研究员
  • 依托单位:中国科学院南海海洋研究所
  • 批准年度:2007
中文摘要:

采用部分基因组文库构建、顺磁颗粒-杂交富集法进行了华贵栉孔扇贝的微卫星开发,经过在群体中对其多态性进行分析、定量评估,获得了57个多态微卫星标记。各标记等位基因数目从2到19个不等,平均6.37个;观测杂合度在0.032到0.93 之间,而期望杂合度为0.033到0.939之间;检测表明33个座位符合哈迪-温伯格平衡,其余24个座位显示偏离哈迪-温伯格平衡;6对基因座位上存在明显的连锁不平衡。利用15个微卫星分子标记研究了5个华贵栉孔扇贝群体的遗传变异;检测到等位基因数在2-10 之间,观测杂合度在0.48-0.55之间,属遗传多样性水平中等;野生群体观测等位基因数最低(4.67),而观测杂合度最高(0.55);但养殖群体则相反,观测等位基因数和杂合度分别高于和低于野生群体,表明其群体多为来源不同的混合群体。确定了华贵栉孔、虾夷和栉孔扇贝的线粒体基因组序列(17935、20 964 和 17035 bp);其基因组长度变异主要由于非编码区的长度和数目变化,而基因含量差异则主要来源于tRNA基因的数目差异。基因重排的进化途径分析表明,邻近的基因区域转位可能在基因组进化中发挥重要作用。

结论摘要:

英文主题词Chlamys nobilis; development;microsatellite;genetic variation;


成果综合统计
成果类型
数量
  • 期刊论文
  • 会议论文
  • 专利
  • 获奖
  • 著作
  • 3
  • 0
  • 1
  • 0
  • 0
相关项目
喻子牛的项目