随着基因组学迅速的发展和深入,作为模式动物和海洋经济动物的牡蛎,其基因组连锁作图和基因组学研究近年来也有了明显的进展。进一步工作之一是将与免疫、宿主防御、抗逆性、生长及发育等有关的功能基因或QTLs定位于连锁图上。多态EST标记的发展及其基因组作图研究,可以使人们有效地进行有关基因在基因组的结构分布和相互关系研究,并为鉴定QTLs 和利用分子标记辅助育种(MAS)提供候选基因。因此,本课题拟通过DNA多态分析技术,检测40-60个功能基因的部分多态位点,从而发展出多态的EST 标记(SSCP和SNP);然后结合微卫星标记,采用家系样品的连锁作图分析,最终将15-25个基因和10-20个微卫星标记定位于AFLP基因组连锁图上,并将之与其它近缘牡蛎连锁图进行初步的基因组比较和进化研究;同时为太平洋牡蛎基因组研究、QTLs作图和遗传改良提供可靠的基因组连锁数据和奠定良好的基础。