目前,国内外尚未有棉纤维发育转录组图谱构建的报道。基于次生壁加厚期基因表达(mRNA)构建的转录组图谱,排除了重复序列、内含子和间隔序列的干扰,使得依据多态性标记定位的纤维品质性状QTLs更为精细,为纤维品质分子标记辅助选择和纤维品质基因图位克隆提供较基因组分子连锁图谱更为精确的技术平台。本研究以海岛棉Pima90-53、陆地棉中棉所8号构建的包含109个单株的F2群体和120个单株的BC1群体为材料,采用cDNA-AFLP技术,首次构建了棉纤维次生壁加厚期转录组连锁群,该转录组连锁群反映了次生壁加厚期基因的相对位置。首次基于转录组连锁图进行了纤维品质性状QTLs定位和纤维强力基因挖掘。在利用cDNA-AFLP技术获得的TDFs(transcript-derived fragments)基础上,克隆了7个棉纤维发育相关基因,即UDP-葡糖醛酸脱羧酶基因(GhUXS1、GhUXS2和GhUXS3)、同型半乳糖基转移酶基因(GbGAUT1)、肌动蛋白解聚因子基因(GbADF1)、磷脂酰肌醇4-激酶基因(GbPI4K)和阿拉伯半乳糖蛋白基因(GbAGP4),部分基因在GenBank注册。
英文主题词cotton; fiber development; fiber quality; transcriptome map; QTLs