CobB是细菌依赖于NAD的蛋白质去乙酰化酶,隶属于Sir2(silent information regulator 2)蛋白家族。目前对Sir2蛋白的研究主要集中在真核生物,对原核生物的研究尚在起步阶段。大肠杆菌蛋白质组芯片初步筛选的结果显示,大肠杆菌的GlmU (N-acetyl-D-glucosamine-1-phosphate acetyltransferase)蛋白是CobB的底物蛋白。前期研究表明,GlmU是原核生物特有的酶,对细胞壁的完整性具有重要影响,并与细菌生物膜形成有关,是细菌生长必需基因。并且,细菌生物膜形成机制的研究已成为抗感染研究领域的热点。我们的初步实验结果显示, CobB可能通过对GlmU去乙酰化而调控其活性,进而影响大肠杆菌生物膜的形成。我们计划通过一系列的分子生化和微生物遗传学实验证明这一假设,从而阐明CobB在细菌中的新功能。
CobB;GlmU;biofilm;deacetylation;Escherichia coli
在前期工作中,本实验室和上海交通大学合作,通过大肠杆菌蛋白质组芯片方法系统搜寻,发现GlmU蛋白是CobB的底物蛋白之一。GlmU是原核生物特有的酶,对细胞壁的完整性具有重要影响,并与细菌生物膜形成有关,是细菌生长必需基因。在本研究中,我们用质谱分析技术鉴定出GlmU中有三个乙酰化修饰的赖氨酸残基。利用western-blot方法证实,AcCoA或AcP在体外可作为乙酰基供体参与GlmU的自乙酰化,乙酰化的GlmU可被CobB去乙酰化。敲除cobB基因会导致胞内GlmU乙酰化水平提高。但是进一步酶学实验结果显示以AcCoA为乙酰基供体的自乙酰化不影响GlmU酶活力,并且也不能通过CobB降低GlmU乙酰化水平而调节其酶活力。但是以AcP为乙酰基供体的自乙酰化是可以提高酶活力的,同时AcP还能提高GlmU的磷酸化水平,而且乙酰化程度的提高能进一步提高AcP的磷酸化作用。结果证实,磷酸化是调节GlmU活力的主要方式,而不是乙酰化。 为了进一步阐明cobB基因对生物膜形成的影响,我们对比了cobB基因敲除菌株与野生型菌株生物膜形成情况和全基因转录情况,结果显示,cobB基因的敲除会导致生物膜形成缺陷,而且基因敲除株的生物膜形成相关基因转录也受到抑制。 研究结果说明,cobB基因确实能调控细菌生物膜的形成,并且在体内外CobB都可以调节GlmU的乙酰化水平,但是并不直接影响其酶活力,磷酸化可以提高GlmU酶活力,乙酰化可能是通过调节其磷酸化水平而间接影响其酶活力。 本研究的成果揭示出了CobB调节大肠杆菌生命活动的另一条线索,为大肠杆菌生物膜的形成及致病性的研究提供了新的思路。