拷贝数变异在基因组中分布广,功能强,是人类复杂疾病遗传易感性的内在因素,但与胰腺癌易感性的关系至今未见报道。预实验的高密度芯片结果显示,中国人群6q13区域的一个缺失型拷贝数变异CNV-2640可能与胰腺癌发病相关,而我们的功能实验表明CNV-2640可能远程调控CD109基因表达。6q13区域在多种肿瘤中发生染色体断裂与重排,该区域内的基因如CD109也被证明与肿瘤发病密切相关。据此,我们推测CNV-2640可能通过调控CD109及其他肿瘤相关基因的表达进而影响胰腺癌的遗传易感性。本项目拟通过大样本量(600对)病例-对照研究验证CNV-2640与中国人群胰腺癌易感性的关联关系,并运用染色质构象捕获及新一代测序等技术平台系统研究CNV-2640在全基因组内的远程调控机制,阐明CNV-2640在肿瘤发生发展中的作用机制,为胰腺癌的人群预警及早期预防提供理论依据和新的线索。
Copy number variation;pancreatic cancer;susceptibility;;
拷贝数变异(CNV)可导致个体表型差异并于疾病易感性相关。首先,我们通过包含1 027例病例和1 031例正常对照的病例对照研究,分析了CNV-2640与胰腺癌易感性的关系。我们利用logistic回归模型计算比值比(OR)和95%可信区间(CI),并通过一系列生化实验研究CNV-2640的功能。我们发现CNV-2640拷贝数与胰腺癌易感性显著相关,与2拷贝基因型相比,1拷贝基因型的OR值为1.31(95% CI = 1.08?1.60; P = 0.007)。CNV-2640为具有一致断点的10 379 bp核苷酸插入/缺失变异,精确断点为chr6: 74 648 791?74 659 169。荧光素酶报告基因和环状染色质构象捕获实验发现,在CNV-2640中存在一个与CDKN2B上游功能序列相互作用的活化调控元件。而且CNV-2640 2拷贝基因型个体胰腺组织CDKN2B转录水平显著高于低拷贝基因型携带者。综上所述,本研究发现位于6q13的CNV-2640可能是CDKN2B的远程调控元件,并与胰腺癌易感性相关。