中文摘要：

本项目全面探讨中国南方小型猪的主要组织相容性复合体SLAⅡ 类的DQA、DMA、DMB、DNA和DOB基因的遗传多样性，采用分子多态分型技术（PCR-RFLP、PCR-SSCP）以及克隆测序等技术，探讨Ⅱ类基因在小型猪中的群体遗传变异，并建立基因树和系统树。通过应用进化分析软件，揭示Ⅱ类基因点突变、基于核苷酸、氨基酸水平以及单个氨基酸水平上的选择机制，阐释进化中的基因重组、基因转变、趋同进化和共祖理论等复杂的进化机制。该研究将为微型猪的实验化培育、小型猪的遗传多样的保护提出可行性的分子育种方案，为器官移植、免疫调控、表位疫苗的研制以及抗病育种提供理论参考。

结论摘要：

猪主要组织相容性复合体（SLA）在分子进化、免疫遗传、器官移植和抗病育种中是学科交叉的研究热点。本项目以人同源序列为信息探针，筛选猪EST数据库，运用RT-PCR技术首次在巴马猪中克隆了SLA-DOB1（DQ333334）、DMB（DQ431246）基因，并对其进行了生物信息学的功能分析。SLA-DOB1基因原核表达蛋白质为32.3Kda，组织表达谱表明其在脾脏、胸腺以及淋巴结中高度表达，在心脏、回肠、肾脏和肝脏中度表达，肌肉中无表达。采用PCR-RFLP、PCR-SSCP、DNA二级结构预测以及克隆测序，探讨了华南型（巴马猪、五指山猪、滇南小耳猪）、华北型（荷包猪）、高原型（甘孜藏猪、合作猪）的小型猪SLAⅡ类经典基因DQA与非经典DOA、DOB、DMA、DMB基因的群体遗传差异，建立了基因树以及等位基因树。对分别获得的25个、9个、13个、3个SLA-DQA、DOA 、DOB1、DOB2的新等位基因进行了初步命名。通过序列变异分析，揭示了SLAⅡ类基因基于核苷酸、氨基酸水平进化机制。研究内容按计划完成，培养硕士3名，发表论文9篇，正在投稿SCI论文3篇。