位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
中国小型猪SLA—DMA基因的SSCP分析
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:《畜牧兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S828.2[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]佛山科学技术学院生命科学学院,佛山528231, [2]四川农业大学动物科技学院,雅安625014
  • 相关基金:国家自然科学基金(30300246;30671500)资助项目
中文摘要:

通过对甘孜藏猪、合作猪、巴马猪以及五指山猪4个群体的SLA—DMA基因第2和第3外显子的PCR-SS-CP和序列多态分析表明:SLA—DMA基因的第2外显子没有多态,但第3外显子有2个等位基因的变异。通过优化低离子强度单链构象多态分型条件(LIS-PCR—SSCP)、克隆测序、菌落PCR、菌落不对称PCR及单链DNA二级结构计算机预测等技术,对第3外显子PCR—SSCP复杂带型进行了准确的判定,J等位基因的带型与单链DNA二级结构计算机预测结果之间存在很高的一致性。4群体中SLA—DMA基因的第3外显子共有JJ/JK/KK3种基因型,均达到了Hardy-Weinberg平衡。其中K等位基因频率高于J等位基因频率。杂合度和多态信息含量的高低依次为:巴马猪、五指山猪、合作猪、甘孜藏猪。除甘孜藏猪多态信息含量为低度多态外,其余群体均为中度多态。

英文摘要:

The polymorphisms of exon 2 and exon 3 in the SLA-DMA gene were studied based on the PCR-SSCP patterns and the sequences in Ganzi Tibetan pigs (T), Hezuo pigs (HZ), Bama pigs(BM) and Wuzhishan pigs(WZS), no allelic variation was recognized in the second exon, but two allelic variations were recognized in the third exon in four different miniature breeds of swine. By optimizing a low ionic strength solution (LIS) PCR-SSCP, cloning sequencing, bacterical colony PCR, asymmetric PCR and structure prediction of DNA single-strand, the complicated patterns about allele K and J based on PCR-SSCP in the exon 3 were confirmed. There was highly identity comparing the pattern of allele J with the predicted second structure of DNA singlestrand. The frequencies of three kinds of genotypes JJ, JK, KK in the third exon of SLA-DMA gene were fit with Hardy-Weinberg equilibrium in four populations. The frequency of allele K was higher than that of allele J. Values of the heterozygosity and the polymorphism information contents in the exon 3 of SLA-DMA gene were showed low polymorphism in T, but moderate polymorphisms in BM, WZS,and HZ.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857