Ef-cd基因是从早籼品种6442S-7中发现,位于第3染色体短臂近端部。用6442S-7作供体,6个迟熟籼稻品种作轮回受体,构建了近等基因系(NIL),探明Ef-cd一般可使水稻提早抽穗11~15天,但对有效穗、每穗总粒数、结实率和千粒重等主要农艺性状无显著影响。利用早熟近等基因系D248构建2个F2代群体,将Ef-cd精细定位于2 个标记之间,物理距离约310kb,并且与另2个标记共分离;用这2个共分离标记检测表明,18个早熟NIL的带型均与供体亲本6442S-7相同,而6个迟熟受体亲本的带型均与6442S-7不同;进一步分析显示这2个共分离标记分别位于候选基因OsMADS50的启动子区域和内含子区域。通过测序分析,发现在OsMADS50的启动子区域,D248 与迟熟受体亲本蜀恢881之间存在几处单碱基替换和一处5-bp插入缺失突变。QRT-PCR分析显示D248中OsMADS50表达水平显著高于蜀恢881。因此,认为Ef-cd与OsMADS50等位,或是其上游区域的调控基因。这些连锁标记可用于标记辅助选择,而Ef-cd可望成为一个很有潜力的基因资源用来培育早熟品种。
英文主题词Rice; Earliness; Ef-cd gene; OsMADS50; helpful gene resource