在栽培种中缺少分子标记已经成为许多蔬菜作物分子育种的障碍,本项目以番茄为研究对象,通过对番茄EST和拟南芥菜基因组之间的保守序列比较,确定番茄可能具有内含子的基因以及该基因中内含子的位置和大小,根据保守序列共设计了305对引物,从PI114490、OH88119、OH9242、PI128216、白果强丰、世纪丰、美粉一号、中蔬5号、Micro-Tom、Moneymaker、里格尔87-5和Rio Grande等12份番茄材料的基因组DNA中进行PCR扩增,并对扩增产物进行序列分析,共获得348个SNP和75个Indel标记,其中212个SNP和46个Indel标记可用于栽培番茄,并对这些新发现的分子标记进行了定位。同时研究了PI114490对番茄疮痂病T3小种的抗性,鉴定出一个主效QTL,并利用标记辅助选择手段培育出抗性材料。这项研究为在遗传变异窄的栽培种中开发可利用的分子标记提供了一条简便途径,并为番茄疮痂病抗性遗传和分子标记辅助选择奠定基础。
英文主题词single nucleotide polymorphisms (SNP); Conserved Ortholog Set Intron (COSi); bacterial spot of tomato; genetics of resistance; molecular mapping