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水稻根围和人体洋葱伯克氏菌的基因型比较
  • ISSN号:1001-7216
  • 期刊名称:中国水稻科学
  • 时间:0
  • 页码:74-78
  • 语言:中文
  • 分类:Q933[生物学—微生物学] Q938[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]浙江大学水稻生物学国家重点实验室,浙江杭州310029
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30370951).
  • 相关项目:水稻细菌性谷枯病菌检测技术研究
中文摘要:

洋葱伯克氏菌是一组表型相似但基因型不同的细菌群(Burkholderia cepacia complex,简称Bcc),它存在于水稻生境和医院中,了解水稻根围Bcc菌株基因型的地位对水稻微生物安全性具有重要的意义。以recA基因的HaeⅢ—RFLP技术和基因型特异性PCR扩增为主要方法对来自水稻根围的78株和来自医院的9株Bcc菌株进行了基因型分析。研究表明水稻根围存在Bcc菌株Ⅰ、ⅢB和Ⅴ基因型。其中Ⅴ型为优势菌;而在医院来源的Bcc菌株中,存在Ⅰ、ⅢA和ⅢB型,以ⅢA型菌株最多。这表明我国水稻根围和医院中的洋葱伯克氏菌基因型构成存在差异。同时研究发现水稻根围的Bcc菌群具有明显的遗传多态性,且存在致病力强的Ⅲ型菌株。

英文摘要:

Burkholderia cepacia is regarded as genetically distinct but phenotypically similar bacterial group referring to Burkholderia cepacia complex (Bcc). It's not only found in clinic but also in rice growing environment. It is very important in microbial safety of rice to understand the genomovar status of Bcc. Genomovar analysis was performed among 87 Bcc isolates by means of Hae Ⅲ-recA RFLP assays and specles-specific PCR tests. Three genomovars were found in the rice rhizosphere including Ⅰ , Ⅲ B and Ⅴ , and genomovar Ⅴ was the predominant. Genomovars Ⅰ , Ⅲ A and Ⅲ B existed in the clinical samples, and genomovar Ⅲ A was the most popular. It showed genomovar composition was different between the Bcc strains from the rice rhizosphere and clinical environment. Moreover, the results revealed the genetic diversity of Bcc strains from the rice rhizosphere, and genomovar Ⅲ referred as virulent species in clinic also existed in the rice rhizosphere.

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期刊信息
  • 《中国水稻科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国水稻研究所
  • 主编:程式华
  • 地址:杭州市体育场路359号中国水稻研究所内
  • 邮编:310006
  • 邮箱:cjrs@263.net
  • 电话:0571-63370278
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7216
  • 国内统一刊号:ISSN:33-1146/S
  • 邮发代号:32-94
  • 获奖情况:
  • 首届全国科技期刊评比二等奖,第二届全国优秀科技期刊评比三等奖,农业部浙江省优秀期刊,国家期刊奖百种重点期刊,百种中国杰出学术期刊,中国精品科技期刊,中国国际影响力优秀学术期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17826