位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
基于芯片数据的肺动脉高压特征基因分析
  • ISSN号:1671-4695
  • 期刊名称:《临床和实验医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R543.2[医药卫生—心血管疾病;医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]首都医科大学附属北京朝阳医院检验科,北京100020, [2]北京市呼吸和肺循环疾病重点实验室,北京100020
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(编号:81300044,81200042,81270117,81570049); 北京市自然科学基金面上项目(编号:7162069,7152062); 北京市医管局“青苗”计划(编号:QML20160301); 北京市呼吸和肺循环疾病重点实验室开放课题(编号:2014HXFB03); 北京市科技新星计划(编号:Z121107002512021)
中文摘要:

目的分析肺动脉高压(PAH)肺组织来源的表达谱基因芯片数据,研究差异表达基因。方法检索基因表达谱汇编数据库中GSE15197数据。用非监督性聚类、监督性分类、主成分分析的方法得到可以将PAH肺组织样本与正常对照区分开的显著差异的特征基因。用基因功能注释分析和蛋白间关联分析方法描述PAH特征基因的功能及涉及的相关信号通路。结果与正常对照相比,PAH肺组织表达显著差异特征基因有167个,功能上主要涉及蛋白的乙酰化、磷酸化等生物学术语,且存在着相互关联作用。结论 PAH差异表达特征基因及其功能注释不仅为深入研究疾病发生发展机制提供重要线索,也为有效诊断和治疗疾病提供必要理论基础。

英文摘要:

Objective Differentially expressed genes were used to analyze the profiles of gene expression in pulmonary tissue of patients with pulmonary hypertension. Methods The profiles of gene expression were searched and downloaded from Gene Expression Omnibus(GEO)repository and GSE15197 data were used. By using unsupervised clustering,supervised classification,principal component analysis,significant difference between PAH lung tissue samples and normal controls had been recognized. The function of PAH gene and related signaling pathways were described by gene function annotation analysis and protein association analysis. Results In comparison with normal control group,there were 167 differentially expressed genes in PAH lung tissues. It was mainly involved in protein acetylation,phosphorylation and other biological terms,and there was correlation among them. Conclusion The differential expression of PAH gene and its functional annotation can not only provide important clues for further study of pathogenesis in development of the disease,but it also proves to be a theoretical basis for effective diagnosis and treatment of this disease.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《临床和实验医学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:北京市卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:首都医科大学附属北京友谊医院
  • 主编:刘建
  • 地址:北京市西城区永安路95号
  • 邮编:100176
  • 邮箱:LCHYX111@163.com
  • 电话:010-63139243
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-4695
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4749/R
  • 邮发代号:80-494
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 中国中国科技核心期刊
  • 被引量:45659