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山羊c-Myc基因的克隆及序列分析
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:《中国畜牧兽医》
  • 时间:0
  • 分类:S827[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]东北林业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150040
  • 相关基金:基金项目:中央高校基本科研业务费专项资金(DL13EA06-02);国家自然科学基金(31000990).
中文摘要:

为了克隆出山羊c-Myc基因的CDS区序列,本研究利用RTPCR技术,参照GenBank报道的绵羊、牛、猪、马等的c-Myc基因CDS区序列设计出特异性引物,从山羊胚胎皮肤组织中扩增出山羊c-Myc CDS区序列并进行序列分析。结果表明,山羊c-Myc基因CDS区全长1320bp(包括终止密码子),与绵羊c-Myc基因核苷酸序列(GenBank登录号:Z68501.1)比对仅有10处存在差异,其核苷酸序列同源性为99.17%,推导的氨基酸序列同源性为99.09%;与其他物种进行同源性分析结果显示,山羊c-Myc基因CDS区与猪、狼、人、大鼠、小鼠的核苷酸序列同源性分别为91.2%、92.0%、90.2%、86.9%、86.0%,推导的氨基酸序列同源性分别为93.6%、96.1%、92.3%、91.1%、89.6%;生物信息学软件分析结果表明,山羊c—Myc蛋白产物定位于细胞核并含有HLH结构域。本研究为进一步了解c-Myc基因的功能及探讨其在山羊体细胞重编程过程中的作用奠定了基础。

英文摘要:

In order to clone sequence of the coding region of the goat c-Myc gene, this study designed specific primers by refeting to c-Myc genes coding sequence reported in GenBank including sheep,cattle, pigs, horses, etc. , and then amplified c-Myc coding sequence from embryonic skin tissue of goats by using RT-PCR technique and had sequence analysis. The result indicated that CDS of goat c-Myc gene had 1320 bp length including the stop codon. For only 10 differences comparing to sheep c-Myc gene nucleotide sequence (GenBank accession number: Z68501.1), homology reached 99.17 % and homology of deduced amino acid sequence reached 99.09%. Analysis of homology with other species showed that homology of goat c-Myc gene coding region nucleotide sequence was 91.2 %, 92.0%,90.2 %, 86.9 %,86.0 % with pigs, wolves, humans, rats, mice, and homology of deduced amino acid sequence was 93.6 %, 96.1 %, 92.3%,91.1%, 89.6 %. Using bioinformatics software analysis showed that goat c-Myc protein was localized in the nucleus and contained a HLH domain. This study further researched the function of c-Myc gene and laid the foundation of investigating the effect in the process of goat somatic cell reprogramming.

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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619