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人体结肠癌组织样品中基因组DNA甲基化水平的HPLC—ESI MS/MS检测
  • ISSN号:1004-4957
  • 期刊名称:《分析测试学报》
  • 时间:0
  • 分类:O657.63[理学—分析化学;理学—化学] Q523[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]中科院广州地球化学研究所有机化学国家重点试验室,广东广州510640, [2]中国科学院研究生院,北京100049, [3]中南大学湘雅二医院医学实验中心,湖南长沙410011
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(NSFC-40590393);中科院“优秀博士学位论文、院长奖获得者科研启动专项资金”资助项目(2005)(0533041A07);中科院知识创新工程重要方向项目资助(KZCX2-YW-403);中科院研究生创新专项资助(2007)(0733061A07)
中文摘要:

利用多重监测反应模式(MRM),通过对液相色谱及质谱条件的优化,建立了人体结肠癌组织样品中基因组DNA甲基化的高效液相色谱-电喷雾质谱(HPLC—ESIMS/MS)检测方法,对结肠癌组织及癌旁组织中基因组DNA甲基化进行了检测。结果表明,5-甲基脱氧胞苷(5mdC)的检出限是1Pg,线性范围为0.0375~0.5mg/L,工作曲线相关系数大于0.9990,该方法的相对标准偏差为2.32%~9.21%。结肠癌病人样品检测结果表明,结肠癌组织基因组DNA甲基化水平低于相应的癌旁组织(P〈0.05)。

英文摘要:

A sensitive and precise method for the quantification of global DNA methylation level in human colon cancer tissues was developed by liquid chromatography - electrospray ionization tandem mass spectrometry with multiple reaction monitoring(MRM) mode under optimized conditions. This method was used to detect the global DNA methylation level of the colon cancer tissues and non-cancerous tissues from colon cancer patients. Results showed that the detection limit was 1 pg for 5mdC (S/N = 5.6) , the linear range of calibration curve was 0. 037 5 - 0. 5 mg/L for 5mdC with the correlation coefficient higher than 0. 999 0. The relative standard deviations(RSD) ranged from 2.32% to 9.21% . Results also indicated that the global DNA methylation level in colon cancer tissues was significantly less than that of non-cancerous tissues(P 〈0. 05).

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期刊信息
  • 《分析测试学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省科学技术厅
  • 主办单位:中国分析测试协会 中国广州分析测试中心
  • 主编:陈小明
  • 地址:广州市先烈中路100号34栋B201中国广州分析测试中心内
  • 邮编:510070
  • 邮箱:fxcsxb@china.com
  • 电话:020- 37656606
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-4957
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1318/TH
  • 邮发代号:46-104
  • 获奖情况:
  • 获广东省第一、二届优秀期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:25362