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簇毛麦HMW-GS及其启动子基因的克隆与序列分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:西北植物学报
  • 时间:0
  • 页码:0859-0866
  • 语言:中文
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]西北农林科技大学农学院,陕西杨陵712100, [2]西北农林科技大学生命科学学院,陕西杨陵712100
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(30771345);教育部“新世纪人才支持计划”(NCET-06-0862);陕西省“13115”重大科技专项(2007ZDKG01)
  • 相关项目:华山新麦草谷蛋白和醇溶蛋白基因向普通小麦的导入及其分子克隆和品质效应研究
中文摘要:

利用2对特异引物,从簇毛麦(Dasypyrum villosum)基因组中分离克隆出一个簇毛麦HMW—GS基因VHG-2(GenBank登录号为FJ600492)及其启动子序列VHGp-1(GenBank登录号为FJ600489)。VHGp-1序列长度为1099bp,从5’至3’方向依次有E—box、N—box、G-box、HMW谷蛋白特异38bp增强子和TATA—box等典型的HMW—GS基因启动子作用调控元件,说明VHGp—1为簇毛麦HMW—GS的启动子基因。VHG-2序列长度为1572bp,具有单一完整的、可编码498个氨基酸的开放阅读框(ORF),该ORF推导的氨基酸序列结构分析表明,编码区依次包含由21个氨基酸残基组成的信号肽、105个氨基酸残基组成的N一末端区、330个氨基酸残基组成的中部重复区和42个氨基酸残基组成的c-末端区;中部重复区主要重复单元为6肽(PQQGQQ)和9肽(GYYPTSP/LQQ);有6个半胱氨酸残基(Cys),其中5个分布在N一末端区,1个分布在C-末端区,第3、4个相邻。这些特征与报道的r型HMW—GS多肽结构基本一致,说明VHG-2是簇毛麦的y-型HMW—GS基因。系统进化分析表明,簇毛麦HMW—GS启动子序列(VHGP—1)与智利大麦(H.chilense)H基因组的12)-hordein基因、拟鹅观草和阿拉善鹅观草St基因组的HMw—GS基因的启动子具有比较近的同源关系,簇毛麦HMW—GS基因(VHG-2)与冰草、拟鹅观草和中间偃麦草的y-型HMW—GS基因具有较近的同源关系。

英文摘要:

A HMW-GS gene VHG-2 ,GenBank accession No. is FJ600492 ,and its promoter sequence VHGp- 1 ,GenBank accession No. is FJ600489, was isolated and cloned from the genome of D. villosum. VHGp-1, sequence length of 1 099 bp, contains E-box, N-box, G-box, HMW glutenin specific 38 bp enhancer and TA- TA-box,which were promoter role regulatory elements of the typical HMW-GS gene. It indicated that VH- Gp-1 is a HMW-GS promoter gene of D. villosum. VHG-2,sequence length of 1 572 bp,has a single complete open reading frame (ORF) or coding region, which can encode 498 amino acids. The deduced amino acid sequence of this coding region contains the signal peptides (9.1 residues),N-terminal region (105 residues) ,the central repeat region (330 residues), and C-terminal region (42 residues). In repeat domains, hexapeptide (PGQGQQ) and nonapeptide (GYYPTSP/LQQ) were mainly repeating unit. The sequence predicts six cysteine residues, five within N-terminal and one within C-terminal domains,and 3^rd and the 4^th cysteine is neighboring. These structure characteristics are typical in y-type HMW glutenin subunits, and suggested that VHG-2 is a y-type HMW-GS gene of D. villosum. Phylogenetic analysis showed that the promoter VHGP-1 was closely related with the D-hordein promoter gene of H genome in H. chilense. The HMW-GS gene VHG-2 has a relatively close homology with y-type HMW-GS gene of Agropyron elongatum and Pseudoroegneria stipifolia.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104