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基于TSP的构建系统发生树的蚁群算法
  • ISSN号:1002-8331
  • 期刊名称:《计算机工程与应用》
  • 时间:0
  • 分类:TP301[自动化与计算机技术—计算机系统结构;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]扬州工业职业技术学院电子信息工程系,江苏扬州225127, [2]扬州大学信息工程学院,江苏扬州225009, [3]南京大学软件新技术国家重点实验室,南京210093
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.60673060 No.60773103); 江苏省自然科学基金(No.BK2008206); 江苏省教育厅自然科学基金(No.08kjb520012)
中文摘要:

受TSP问题的启发,提出一种基于TSP构建系统发生树的蚁群算法(TSP-PTC)。该算法将物种集合用一个带权图G表示,并利用蚁群算法在图中搜索一条最优路径,最终系统发生树用最优路径及距离矩阵构建而成。用该方法构建出来的系统发生树是一棵带权树,它不仅可以表示物种之间的进化关系,而且可以粗略地表示出物种之间的进化时间。

英文摘要:

Given a set of species and their distance matrix,TSP-PTC builds a weighed graph where each Hamilton circuit represents a phylogenetic tree.Among the phylogenetic trees corresponding to all circle paths,the optimal tree with minimum fitness value is the one which is corresponding to the solution of TSP.Artificial ants can be used to search an optimal path in the weighed graph.The optimal tree can be constructed by the optimal path and the distance matrix.

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期刊信息
  • 《计算机工程与应用》
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  • 1. 2012年首批获得中国学术文献评价中心发布的 “...,2. 2001年获得新闻出版署“中国期刊方阵双效期刊”,3. 2008年首批入选国家科技部“中国精品科技期刊...,4.2003年-2011年连续获得工业和信息化部期刊最高...
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