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侵染白菜的黄瓜花叶病毒分离物基因组的全序列分析
  • ISSN号:0513-353X
  • 期刊名称:《园艺学报》
  • 时间:0
  • 分类:S634.3[农业科学—蔬菜学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]浙江理工大学生物工程研究所,杭州310018, [2]湖南农业大学生物安全科技学院,长沙410128
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30671361);科技部国际合作重点项目(2004DFA05000)
中文摘要:

对浙江省杭州地区白菜(Brassica campestris L.ssp.chinensis vat.commuis Tsen et Lee.)上获得的CMV分离物(CMV-CTL)进行了全长克隆和基因组序列分析。结果显示:CMV—CTL的RNA1(Gen—Bank序列号:EF213023)全长为3357个核苷酸(nt),编码993个氨基酸(aa)的1a蛋白;RNA2(Gen-Bank序列号:EF213024)全长为3047nt,编码858aa的2a蛋白和111aa的2b蛋白;RNA3(GenBank序列号:EF213025)全长为2217nt,编码278aa的MP蛋白和218aa的CP蛋白。序列相似性分析表明,CMV-CTL与CMV亚组B中株系IA相似性最高,RNA1、RNA2和RNA3与该株系的相似性分别为91.3%、91.3%和93.6%。CP基因和RNA3的5′NTR核酸序列系统发生树分析表明,CMV—CTL与中国大多数CMV分离物一样,属于CMV亚组IB。

英文摘要:

Isolate CMV-CTL was obtained from Brassica campestris L. ssp. chinensis var. commuis Tsen et lee. , in Hangzhou, Zhejiang Province. The full-length cDNA sequence of genomic RNAs of the isolate was determined by RT-PCR and sequencing. The results showed that CMV-CTL RNA1 (GenBank accession No. EF213023 ) consists of 3 357 nucleotides (nt), encoding 1a protein of 993 amino acids residues (aa). RNA2 (GenBank accession No. EF213024) consists of 3 047 nt, encoding 2a protein of 858 aa and 2b protein of 111 aa. RNA3 (GenBank accession No. EF213025) contains of 2 217 nt, encoding 3a protein of 278 aa and CP of 218 aa. CMV-CTL showed the highest sequence identities with strain IA which belongs to CMV sub- group IB. The sequence identities of RNA1, RNA2 and RNA3 between CTL and IA strains were 91.3%, 91.3% and 93.6%, respectively. Phylogenetic analysis of CP and 5′NTR of RNA3 suggested that CMV-CTL belongs to CMV subgroup IB.

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期刊信息
  • 《园艺学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国园艺学会
  • 主编:杜永臣
  • 地址:北京市中关村南大街12号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:ivfyyxb@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-68919523
  • 国际标准刊号:ISSN:0513-353X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1924/S
  • 邮发代号:82-471
  • 获奖情况:
  • 第一届全国优秀期刊奖,中国科协第三届优秀期刊奖,第二届国家期刊奖提名奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:43371