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猪链球菌2型主要毒力因子三重荧光定量PCR检测方法的建立
  • ISSN号:1674-6422
  • 期刊名称:《中国动物传染病学报》
  • 时间:0
  • 分类:S852.611[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:中国农业科学院上海兽医研究所, 南京农业大学动物医学院
  • 相关基金:公益性行业(农业)科研专项(201303045)
中文摘要:

根据GenBank中猪链球菌2型三种毒力因子CP2SJ、MRP、EF基因序列,利用Primer Express 3.0软件分别设计3对特异性的引物及相应的Taqman探针。CP2SJ、MRP、EF探针5′端分别标记FAM、HEX、CY5荧光发射基团,3′端标记BHQ1淬灭荧光基团。通过优化反应体系和程序,建立了一种基于Taqman探针法的三重荧光定量PCR,可同时检测上述三种毒力基因。该方法灵敏度高,CP2SJ、MRP、EF的最低检测限分别为90、40、60拷贝数/μL的质粒;特异性强,与其他病原菌无交叉反应;重复性好,变异系数均小于3%。整个检测扩增在60 min内完成。以上结果表明本试验所建立的三重荧光定量PCR方法的敏感性、重复性及特异性均较好,可用于同时快速检测猪链球菌2型三种毒力因子。

英文摘要:

In this study, triple TaqMan real-time PCR assay was developed to simultaneously detect virulence genes CPS2J, MRP and EF of Streptococcus suis serotype 2. Three pairs of specific primers and fluorogenic-labeled probes were designed and synthesized in accordance with the above target genes using software Primer Express 3.0. The 5′-ends of probes for CPS2J, MRP and EF were individually labeled with FAM, HEX and CY5 and their 3′-ends were all labeled with quencher BHQ1. The reaction system and procedures were optimized. The detection limits for purified recombinant plasmids of CPS2J, MRP and EF were 90, 40 and 60 copies/μL, respectively. There was no cross reaction between Streptococcussuis serotype 2 and other pathogens. The variation coefficient of the established method was less than 3%. The entire detection could be completed within 60 min. In conclusion, the triple TaqMan Real-time PCR assay developed in the present study was fast, sensitive, repeatable and specific.

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期刊信息
  • 《中国动物传染病学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院上海兽医研究所
  • 主编:童光志
  • 地址:上海市闵行区紫月路518号
  • 邮编:200241
  • 邮箱:bianjibu@shrri.ac.cn
  • 电话:021-34293142
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-6422
  • 国内统一刊号:ISSN:31-2031/S
  • 邮发代号:4-748
  • 获奖情况:
  • 第二届全国畜牧兽医优秀期刊二等奖,首届《CAJ-CD规范》执行优秀奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:1517