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旱生植物梭梭actin基因片段的克隆及表达模式分析
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:基因组学与应用生物学
  • 时间:2014.6.28
  • 页码:1-
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]兰州大学草地农业科技学院,兰州730020
  • 相关基金:教育部“长江学者和创新团队发展计划”(IRT13019); “新世纪优秀人才支持计划”(NCET-11-0217); 国家自然科学基金项目(31222053); 中央高校基本科研业务费专项资金(lzujbky-2013-k08)共同资助
  • 相关项目:草类植物逆境生理
中文摘要:

本研究根据其它植物actin基因的保守序列设计一对简并性引物,以3周龄梭梭整株总RNA为模板,采用RT-PCR的方法扩增出actin基因片段并克隆到PUCm-T载体,阳性克隆经PCR检测后进行测序。序列分析结果表明:该片段长约598 bp,编码198个氨基酸;该序列与GenBank中现有的植物Actin比对发现,同源性均高达84%,同时,翻译得到的氨基酸序列与其它植物的氨基酸序列同源性高达99%。表达实验分析表明在不同胁迫条件下该基因在梭梭不同组织中表达量恒定,可作为内参基因。梭梭actin基因片段的克隆可为研究重要抗逆功能基因在梭梭中的表达和调控机制奠定基础。

英文摘要:

In this paper degenerated primers were designed according to the conserved sequences of the actin gene from other plant species. Total RNA was extracted from the whole plant of Haloxylon ammodendron. actin gene fragment was obtained by reverse transcription polymerase chain reaction(RT-PCR) and cloned into PUCm-T vector. The positive clone identified by PCR was sequenced. The sequenced results indicated that the actin gene fragment of H. ammodendron contains about 600 bp, encoding 198 amino acids. Homology comparison with actin genes from other plant species in the GenBank indicated that HaACT shared more than 84% nucleotide and 99%amino acids sequence homology. Expression pattern analysis showed that under various stress conditions the gene expressed stably in the different organization of H. ammodendron. Our result confirmed that HaACT can be used as a housekeeping gene. This work lays a foundation for application of actin gene in characterizing other important genes relevant to stress resistance in xerophyte H. ammodendron.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299