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应用微阵列芯片分析人脂肪源干细胞成骨分化miRNA表达差异及靶基因预测
  • ISSN号:1674-134X
  • 期刊名称:中华关节外科杂志(电子版)
  • 时间:2013.4
  • 页码:226-230
  • 分类:R966[医药卫生—药理学;医药卫生—药学]
  • 作者机构:[1]中山大学附属第一医院骨科,广州510080, [2]广东省医学科学院、广东省人民医院骨科
  • 相关基金:国家自然科学基金(81171709,81201388)
  • 相关项目:软骨细胞生长相关miRNA、C/EBPβ和Runx2循环协控促进梯度材料复合ADSCs成软骨分化的机制
中文摘要:

目的运用微阵列芯片技术分析人脂肪源干细胞在成骨诱导分化前后miRNA表达谱的差异,并预测其靶基因。方法提取人脂肪源干细胞成骨分化前后的miRNA,分别与哺乳动物miRNA芯片V3.0杂交,应用SAM和Cluster软件进行数据分析,对有显著差异的miRNA进行实时荧光定量PCR验证,并通过miRBase数据库预测其靶基因。结果共筛选出9个差异表达miRNA,has-miR-17、has-miR-20a、has-miR-20b、has-miR-106a、has-miR-199b-5p显著上调,has-miR-125a-5p、has-miR-125b、has-miR-31、has-miR-193a-3p显著下调。结论人脂肪源干细胞成骨诱导分化前后存在明显的miRNA差异表达,预测到部分靶基因。

英文摘要:

Objective To screen the osteogenesis-specific miRNAs and forecasting target gene in human adipose-derived stem cells (ADSCs). Methods Three pairs of microRNAs of osteo-differentiated human ADSCs were collected. miRNAs were screened by microarray technique, and analysis with SAM and Cluster software. miRNAs were confirmed by qRT-PCR. Results Total nine different miRNAs were found, among which has-miR-17, has-miR-20a, has-miR-20b, has-miR-106a, and has-miR-199b-5p were up-regulated, while has-miR-125a-5p, has-miR-125b, has-miR-31, and has-miR-193a-3p were down-regulated. Conclusions There was differential miRNAs expression during ADSCs osteo-differentiation and some of the target genes were forcasted.

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期刊信息
  • 《中华关节外科杂志(电子版)》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:广州市沿江西路151号广州医科大学附属第一医院门诊大楼8楼
  • 邮编:510120
  • 邮箱:cjojs@126.com
  • 电话:020-83062381
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-134X
  • 国内统一刊号:ISSN:11-9283/R
  • 邮发代号:82-554
  • 获奖情况:
  • 中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊
  • 被引量:5955