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芯片瞬间等速电泳-筛分电泳偶联分析精确计算DNA长度
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:TS101.922[轻工技术与工程—纺织工程;轻工技术与工程—纺织科学与工程] Q523.03[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]广州医学院附属市一人民医院检验科临床化学技术研究室,广州510180, [2]广东省第二人民医院检验科,广州510317
  • 相关基金:“十一五”重大专项(No.2008ZX10004-004)、国家自然科学基金(No.30870753)和广东省科技计划项目(No.2008B060600036)资助
中文摘要:

建立了基于相对迁移时间比例的方法,依据待侧DNA片段相对于上位及下位内标的迁移时间比例进行长度预测。实验结果显示,DNA片段的相对迁移时间比例在不同分析条件下具有良好的重现性。通过建立相对迁移时间比例相对于DNA片段长度的对应关系公式,实现了芯片瞬间等速电泳条件下DNA片段长度的准确预测。实际样品分析证实这种基于相对迁移时间比例的计算方法简单可靠,适合于芯片tITP-CGE分析中DNA长度的精确判定。

英文摘要:

The migration-time in transient isotachophoresis (tITP) separation is affected by sample salinity as the dependence of ITP time on sample-zone conductivity.The sample-to-sample variation of migration-time in microchip tITP-CGE analysis is an undesired factor for precise DNA sizing.In this work,a DNA sizing method that based on relative migration-time proportion (RMP) was developed to eliminate the effect of sample salinity on sizing precision.RMP was defined as the ratio of the migration-time difference between the target fragment and the lower marker to that between the upper marker and the lower marker.The RMP values were tested to be reproducible in microchip tITP-CGE separations irrespective of sample salinity.Size of a target DNA was predicted by fitting its RMP value to the equation derived from RMPs of standard DNA ladder vs.DNA sizes.The precision and reproducibility of the sizing method were validated testing multiple standard PCR amplicons.Experimental results showed that the RMP method is simple and reliable,thus well suited to precise DNA sizing with microchip tITP-CGE analysis.

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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455