位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
芯片电泳快速检测乙型肝炎病毒YMDD变异
  • ISSN号:1005-4529
  • 期刊名称:《中华医院感染学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R512.62[医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]广州医学院附属广州市第一人民医院检验科,广东广州510180, [2]广州市第八人民医院检验科,广东广州510060
  • 相关基金:国家“十一五”传染病防治重大专项(2008ZX10004-004) 国家自然基金(30870753) 广东省科技计划项目(73090) 广东省自然基金(9151008901000190) 广东省医学科研基金(A2007499、A2009518) 广州市医药卫生基金(2008-YB-003、重点项目:2009-Zdi-10、2009-Zdi-21) 广州市中医药、中西医结合科研资助项目(2009-A-07)
中文摘要:

目的利用芯片电泳高分辨力和分析快速的优点,建立一种基于芯片电泳的乙型肝炎病毒YMDD耐药性突变的检测方法。方法利用序列特异性PCR联合芯片电泳检测乙型肝炎病毒YMDD变异;将YVDD、YIDD标准质粒分别按梯度稀释10^8~10^0。进行检测,将10^5拷贝/μlYVDD、YMDD质粒及YIDD、YMDD质粒分别按99:1、50:50、20:80、10:90、5:95、1:99混合检测,评价该方法的灵敏度;用芯片电泳法检测86份经拉米夫定治疗慢性乙型肝炎患者血清样品中YMDD突变情况,并将其结果与荧光定量PCR比较;两种方法结果不一致的标本进行DNA测序鉴定。结果芯片电泳法能够在3min内实现HBVYMDD变异检测,标准YVDD、YIDD质粒的检测限均为10^1拷贝/μl;不同比例(V:M或I:M)的混合质粒,最小比例突变检测率YVDD为5.0%,YIDD为10.0%;在86份标本中,芯片电泳检出总变异65份,突变率为75.6%,其中YVDD变异32份、YIDD变异23份、YVDD4-YIDD混合变异为10份,荧光定量PCR检出总变异62份,突变率为72.1%,其中YVDD变异30份、YIDD变异29份、YVDD+YIDD混合变异为3份,两种方法检测结果差异无统计学意义(Kappa=0.609);两种方法检测结果不一致的标本20份,经测序结果显示,YMDD野生株6份、YVDD变异7份、YVDD+YIDD混合变异7份。结论芯片电泳法检测YMDD变异具有简单、快速、灵敏度和准确度高的优点,适合于临床实验室开展乙型肝炎病毒YMDD变异的检测。

英文摘要:

OBJECTIVE To establish a rapid, high performance method for detecting hepatitis B virus YMDD resistance mutation by high-resolution and fast analysis advantages of microchip electrophoresis. METHODS Combined with sequence-specific PCR and microchip electrophoresis to detect hepatitis B virus YMDD variation, the standard plasmids with YVDD, YIDD were diluted to 108 --10o , with l0s copies/ml YVDD, YMDD plasmids and YIDD. The sensitivity of this method was evaluated with YMDD mixed plasmids of 99 : 1, 50 : 50, 20 : 80, 10 : 90, 5 : 95, 1 : 99. Eighty-six cases from the chronic hepatitis B patients treated with lamivudine in the YMDD mutation were detected and their results were compared with the fluorescent quantitative PCR. The specificity of the two methods was compared. The results inconsistent was performed the direct DNA sequencing. RESULTS Microchip electrophoresis could detect hepatitis B virus YMDD mutations within 3 minutes, and its detection sensitivity was 101 copies/ml standard template of the product. The minimum mutation rate of YVDD

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《中华医院感染学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国人民解放军总医院
  • 主办单位:中华预防医学会
  • 主编:
  • 地址:北京复兴路28号
  • 邮编:100039
  • 邮箱:zhyygrxzz@21cn.com
  • 电话:010-66939464
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-4529
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3456/R
  • 邮发代号:82-747
  • 获奖情况:
  • 中华预防医学会期刊评比优秀奖,中华预防医学会期刊评比编辑奖,中华预防医学会期刊评比学术奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:111886