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两整体基因交互作用的核典型相关分析
  • ISSN号:1000-8020
  • 期刊名称:卫生研究
  • 时间:2015.7.30
  • 页码:666-670
  • 分类:R195.1[医药卫生—卫生统计学;医药卫生—卫生事业管理;医药卫生—公共卫生与预防医学]
  • 作者机构:[1]郑州大学公共卫生学院,郑州450001, [2]郑州大学基础医学院, [3]焦作市人民医院护理部
  • 相关基金:国家自然科学基金(No.81001280,81202277)
  • 相关项目:PRDM16基因甲基化与肥胖关系的分子流行病学研究
中文摘要:

目的基于核典型相关分析,研究两整体基因的交互作用。方法通过统计模拟实验,在基于群体的病例对照研究中,运用核典型相关分析,构建FTO基因和PRDM16基因交互作用的KCCU统计量,并进行检验与评价。结果 KCCU统计量的检验效能与检验水准、样本含量、最小等位基因频率有关,且两整体基因交互作用量越大时,检验效能越高。当检验水准为0.05,基因频率高于0.05,交互作用OR〉1.5,样本量〉5000时,KCCU检验效能达0.8以上。结论在大样本高交互研究中,KCCU统计量是一种科学有效的检验整体基因间交互作用的统计推断方法。

英文摘要:

Objective To detect the gene-based gene-gene interaction by kernel canonical correlation analysis. Methods Based on case-control study, statistical simulation studies were conducted to construct and test the KCCU statistic to evaluate gene-based gene-gene interaction of gene FTO and gene PRDM16 by kernel canonical correlation analysis. Results The power of KCCU statistic was related to significant level,sample size, minor allele frequency, and it was higher when the gene-gene interaction increased. The power arrived 0. 8 at the significant level of 0. 05 when the minor allele frequency was higher than 0. 05,the interaction odds ratio was higher than1. 5,and the sample size was greater than 5000. Conclusion KCCU statistic is a valid and powerful statistical inference method for detecting gene-based gene-gene interaction in the large sample analysis with high interaction.

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期刊信息
  • 《卫生研究》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中国疾病预防控制中心
  • 主编:段国兴
  • 地址:北京市西城区南纬路29号
  • 邮编:100050
  • 邮箱:wsyj2012@126.com
  • 电话:010-83132376 83132329
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8020
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2158/R
  • 邮发代号:82-720
  • 获奖情况:
  • 国家双百期刊,第二届国家期刊奖百种重点期刊,1997年《卫生研究》荣获第二届全国优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22260