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PRRSV广东株XH—GD的分离及其NSP2、ORF3、ORF5的序列分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S852.65[农业科学—基础兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]海南省农科院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室,海南海口571100, [2]华南农业大学农业部兽用疫苗创制重点实验室,广东广州510642
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金(31272564);国家自然科学基金会(NSFC)-广东联合基金项目(U0931003);国家现代农业产业技术体系专项(CARS-36);海南省科学事业费项目(琼财预【2013]131号)
中文摘要:

将采集的广东某猪场疑似猪高热症病料处理后接种于Marc-145细胞,出现细胞聚集、固缩、脱落等特异性细胞病变。根据GenBank中猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的基因序列设计并合成针对NSP2、ORF3和ORF5基因的引物,扩增目的基因并测序分析。结果表明:分离毒株XH—GD株PRRRSV属于美洲型,且NSP2基因发生30个氨基酸的不连续缺失;XH—GD的NSP2、ORF3和ORF5基因与HUB1、NX06、BJsy06、VR-2332、HB—1(sh)2002、HB-2(sh)2002、CH—1a和RespPRRSMLV等毒株等位基因的核苷酸同源性分别为83.3%-98.9%、88.6%~99.2%、88.1%~99.2%,推导的氨基酸同源性分别为76.8%~98.3%、83.7%~98.8%、88.1%~99.2%;而与Lv的等位基因核苷酸同源性分别为52.9%、65.0%和64.3%,推导的氨基酸同源性分别为31.3%、57.5%和58.9%。基因系统发育树分析表明,XH—GD与NX06、BJsy06株的亲缘关系很近,与HUB1、NX06、BJsy06、VR-2332、HB-1(sh)2002、HB-2(sh)2002、CH—1a和RespPRRSMIJV亲缘关系较近,与LV毒株处于不同的分支。

英文摘要:

The samples collected from Guangdong province were inoculated to Marc-145 cell, the PRRSV specific cytopathogenic effect (CPE) was observed and the isolates named XH-GD obtained. After reverse transcription polymerase chain reaction, the amplified NSP2,0RF3 and ORF5 fragments were analyzed by sequence comparison. The results demonstrated that XH-GD belonged to the North American genotype and its NSP2 had 30 amino acids deletion. The NSP2, ORF3 and ORF5 of XH-GD shared 83.3%-98.9%, 88.6%~ 99.2% and 88.1%-99.2% of nucleotide similarity, and 76.8%-98.3%, 83.7%-98.8% and 88.1%-99.2% of deduced amino acid similarity, with that of HUB1, NX06, BJsy06, VR-2332, HB-1 (sh)2002, HB-2 (sh)2002, CH-la and RespPRRS MLV respectively; and shared only 52.9%, 65.0% and 64.3% of nucleotide similarity, and 31.3%, 57.5% and 58.9% of deduced amino acid similarity with that of LV respectively. The phylogenetic tree revealed XH-GD had closer relationship with HUB1, NX06, BJsy06, VR-2332, HB-1(sh)2002, HB-2 (sh)2002, CH-1a and RespPRRS MLV strains than that of LV strain.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995