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作物中4-香豆酸辅酶A连接酶的遗传进化分析
  • ISSN号:1001-7283
  • 期刊名称:《作物杂志》
  • 时间:0
  • 分类:S793.2[农业科学—林木遗传育种;农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]东北农业大学生命科学学院,黑龙江哈尔滨150030, [2]齐齐哈尔大学生命科学与农林学院,黑龙江齐齐哈尔161006
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31070291); 齐齐哈尔市科学技术项目(NYGG-201206-4)
中文摘要:

4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL)是苯丙烷类代谢途径的关键酶。2014年着重以水稻、大豆、玉米为研究对象,通过收集4CL基因完整的c DNA和编码氨基酸序列的数据,利用Mobyle、EMB0SS、DNAMAN以及MEGA5.0和Clustalx 1.83等生物信息学软件对数据进行分析比较,从而对4 CL基因的遗传进化及密码子使用进行分析总结。本研究构建了4CL的系统发生树,研究基因的密码子偏好性,比对分析酶的保守区,为进一步研究4-香豆酸辅酶A连接酶在农作物中的应用提供理论支持,为研究其次级代谢产物木质素及黄酮类物质的合成、积累和调控奠定基础。

英文摘要:

4-coumarate CoA ligase (4CL)is a key enzyme in the phenylpropanoid metabolic pathway. In this study, O. Sativa ,Z. Mays, G. Max were used as research materials and through the data collection about 4CL gene encoding the complete cDNA and amino acid sequences, Mobyle, EMBOSS, DNAMAN, MEGA 5.0 and Clustalx 1.83 bioinformatics softwares were used for data analysis and comparison on the genetic evolution and codon of 4CL gene. The phylogenetic tree of the 4CL was constructed, codon preference in gene conservative region and the analysis of en- zyme were compared to provide the theoretical support for the further study of 4CL in crops. The research foundation was extablised for the synthesis, accumulation and regulation of lignin and flavonoids.

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期刊信息
  • 《作物杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:杜振华
  • 地址:北京中关村南大街12号中国农科院作物所内
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwzz304@mail.caas.net.cn
  • 电话:010-82108790
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7283
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1808/S
  • 邮发代号:82-220
  • 获奖情况:
  • 第三届全国优秀农业期刊奖,中国科协科技期刊三等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:13960