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家蚕新的非编码RNA功能初探
  • ISSN号:1003-0972
  • 期刊名称:信阳师范学院学报(自然科学版)
  • 时间:2012.10.10
  • 页码:490-494
  • 分类:Q522[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]河南农业大学生命科学学院,河南郑州450002, [2]南阳师范学院河南省伏牛山昆虫生物学重点实验室,河南南阳473061
  • 相关基金:973国家重大科技专项子项目(2009CB825400); 国家自然科学基金项目(31172158)
  • 相关项目:调控家蚕发育非编码RNA(non-coding RNA, ncRNA)的功能解析
中文摘要:

构建了家蚕50~500 nt非编码RNA的cDNA文库,发现了189个新的ncRNA,其中一个小RNA-Bm-86在家蚕幼虫和蛹中的表达量显著高于卵和成虫.利用生物信息学软件对该ncRNA的特性及其与上下游基因的关系进行了深入分析,并利用Northern杂交和半定量RT-PCR技术对该ncRNA与其宿主基因在家蚕不同组织的表达情况进行了研究.结果发现,该ncRNA属于H/ACA box snoRNA家族,是由家蚕eIF5A基因的第二个内含子转录产生的,且在家蚕中没有明显的靶标位点.分析其上下游基因结构发现,在其上游263 bp处存在着一个可能的启动子位点,表明其有独立转录的倾向.进一步分析Bm-86与其宿主基因eIF5A在家蚕不同组织部位的表达情况发现,二者在表达上存在着负相关的关系,且该现象在丝腺中尤其明显.推测Bm-86可能通过影响eIF5A基因的表达参与到家蚕丝腺发育调控过程中.

英文摘要:

The cDNA library of 50-500 nt ncRNAs in Bornbyx mori were constructed, and a small RNA Bin-86 accumulated more in larva and pupa during development was found. To further dissect the function of this ncRNA, bioinformatics analysis, northern blot and RT-PCR were taken out. Results showed that Bm-86 was an H/ACA box small nucleolar RNA, located in the second intron of eIF5A, with no predicted pseudouridylation modification site in rRNAs, snRNAs and tRNAs of B. mori. Moreover, a putative promoter were located 263 bp upstream of Bm-86, which indicated that Bm-86 might be transcribed independently. Further analysis showed that the expression of Bin-86 exhibited negative correlation with its host gene eIF5A, notably in silkgland, which indicated that Bin-86 might be involved in the development of silkgland through regulating the expression of eIF5A.

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期刊信息
  • 《信阳师范学院学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:信阳师范学院
  • 主办单位:信阳师范学院
  • 主编:刘彦明
  • 地址:河南省信阳市南湖路
  • 邮编:464000
  • 邮箱:xblk@xynu.edu.cn
  • 电话:0376-6393516
  • 国际标准刊号:ISSN:1003-0972
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1107/N
  • 邮发代号:36-122
  • 获奖情况:
  • 河南省优秀科技期刊,河南省优秀学报
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,德国数学文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5214