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利用5'LongSAGE标签分析蜜蜂肌球蛋白调节性轻链基因MLC-2选择性转录起始位点
  • ISSN号:1000-2286
  • 期刊名称:《江西农业大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:S893.69[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]集美大学生物工程学院,福建厦门361021, [2]泉州师范学院,福建泉州362000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30300183); 福建省教育厅省属高校项目(2008F5051)
中文摘要:

使用西方蜜蜂雄蜂头部5’LongSAGE文库中的肌球蛋白调节性轻链基因MLC-2的标签序列,在蜜蜂全基因组序列上定位了该基因的转录起始位点(TSS),并进而预测了其启动子的结构。结果显示:蜜蜂MLC-2基因存在17个TSS,其中16个定位于MLC-2基因开放阅读框上游100bp的范围内。MLC-2基因的各TSS的使用效率不同,其中有3个优势TSS,由之起始的转录本分别占该基因总转录本数量的9.76%、54.47%和11.38%。从碱基组成来看,蜜蜂MLC-2基因TSS的第1个碱基为A、G、T、C的概率分别为58.8%、29.4%、0和11.8%。MLC-2基因的启动子结构预测结果表明,在TSS上游的300bp区域内有3个核心启动子元件。研究结果对研究蜜蜂MLC-2基因的表达调控与确定其全长cDNA序列具有重要意义。

英文摘要:

The transcription initiation start site(TSS) of a predicted honeybee MLC-2 gene(myosin regulatory light chain 2)was localized on the genome sequence of Apis mellifera with the head of drone's 5'Long-SAGE tags mapping to genome sequences in this study,and the structure of promoter was predicted.The results showed that there were 17 TSSs that were assigned to MLC-2 gene model and 16 tags that mapped in a 100 bp-region upstream of reference start codon.Interestingly,the authors found that those TSSs displayed different initiation efficiency and the MLC-2 mRNA transcripts were started from 3 dominant TSSs,which initiated 9.76%,54.47% and 11.38% respectively of the total transcripts of MLC-2 gene in adult drone head.When base composition of the first base of the 17 alternative TSSs was considered,the authors found that A,G,T and C accounted for 58.8%,29.4%,0 and 11.8%,respectively.Then,the promoter structure of MLC-2 gene was computational analyzed and 3 core promoter elements were predicted in DNA region of 300 bp upstream of TSSs.The precise identification of TSSs was fundamental for the establishment of full-length cDNA sequence and expression regulation of honeybee MLC-2 gene.

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期刊信息
  • 《江西农业大学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:江西农业大学
  • 主办单位:江西农业大学
  • 主编:石庆华
  • 地址:江西省南昌市经开区志敏大道1101号江西农业大学期刊社
  • 邮编:330045
  • 邮箱:ndxb7775@sina.com
  • 电话:0791-83813246 83828010
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2286
  • 国内统一刊号:ISSN:36-1028/S
  • 邮发代号:44-102
  • 获奖情况:
  • 中国期刊方阵双百期刊,国家期刊奖百种重点期刊,中国高校精品科技期刊,华东地区优秀期刊,江西省"名刊建设工程"期刊,江西省优秀期刊一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:20807