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植物修复重金属污染及内生细菌效应
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:微生物学通报
  • 时间:2011
  • 页码:921-927
  • 分类:Q941[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]泉州师范学院化学与生命科学学院,福建泉州362000
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目“重金属污染下互花米草根际与内生菌的群构特征和细菌效应”(31070296); 福建省教育厅科技计划项目“杨梅超氧化物歧化酶基因的分子克隆及表达分析”(JA09212); 泉州市优秀人才培养专项经费资助“杨梅超氧化物歧化酶基因的分子克隆及表达分析”(09A07); 福建省大学生创新性实验计划项目“杨梅超氧化物歧化酶基因的分子克隆及表达分析”(2010CXSY16)
  • 相关项目:重金属污染下互花米草根际与内生菌的群构特征和细菌效应
中文摘要:

扩增杨梅嫩叶中肌动蛋白基因(MrActin1)全长编码区cDNA序列,并评价MrActin1的进化地位,同时分析MrActin1的表达模式。利用RT-PCR扩增MrActin1全长编码区cDNA序列。用生物信息学手段分析预测MrActin1的理化性质和同源性,用临接法构建其的系统发生树。通过Northern blot分析MrActin1在不同组织部位的表达。该基因cDNA序列(GenBank登录号AB650589)全长1137bp,编码了1个由377个氨基酸残基组成的蛋白质,所得序列与GenBank中注册的其他植物Actin氨基酸序列的相似性均在88%以上,根据高等植物Actin相似性构建了进化树,表明MrActin1与陆地棉、圆叶锦葵Actin之间的亲缘关系最为密切,在进化中分化时间最为接近。Northern blot分析表明,MrActin1在杨梅的花、叶、枝条和果组织中恒定表达。首次获得了杨梅MrActin1 cDNA全长编码区序列。

英文摘要:

The aims were to clone a full-length cDNA (MrActin1) of actin from Myrica rubra leaves, and evaluate its evolution status and analyze the expression model of MrActin1. A full-length cDNA of actin was obtained using RT-PCR techniques. The physicochemical properties and homology analyzed by bioinformatics methods. The phylogenetic tree of actin family was constructed by neighbor-joining. The expression model of MrActin1 investigated in various organs of Myrical rubra. The full length of MrActin1 was 1137 bp (GenBank accession No. AB 650589), encoding a protein of 377 amino acids. Homologous alignment showed that it shared over 88% nucleotide sequence similarity. The phylogenetic tree reconstructed on the base of amino acid sequences suggested that the relationship of actin between Myrica rubra and Gossypium hirsutum, Malva pusilla was most intimate and they might have the same differential time in evolution. The analysis by Northern blot showed that MrActin1 was constantly expressed in various organs of Myrical rubra such as flowers, leaves, branches, fruits. The full-length cDNA sequence of MrActin1 was firstly obtained.

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:赫荣乔
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路一号院3号中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:xuj@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807511
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:29487