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麦洼牦牛G蛋白信号转导调节因子5克隆及蛋白结构分析
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:中国畜牧兽医
  • 时间:2015
  • 页码:38-43
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]西南民族大学动物遗传育种国家民委-教育部重点实验室,成都610041
  • 相关基金:中央高校基本科研业务费专项资金项目(2014NZYQN45);牦牛遗传资源保护与利用创新团队项目;研究生点建设项目(2013XWDS071007);自然科学基金(31172198)
  • 相关项目:牦牛乳腺泌乳启动期基因表达谱及初乳期优质基因筛选
中文摘要:

采用RT-PCR方法扩增并克隆麦洼牦牛G蛋白信号转导调节因子5(regulator of G protein signaling 5,RGS5)基因序列,利用ClustalX 1.83和Mega 5.0软件构建系统进化树,并选用多种生物信息学软件进行序列分析和蛋白结构预测。结果表明,所得麦洼牦牛RGS5基因长度为863bp,包含1个546bp的完整开放阅读框,编码181个氨基酸,GenBank登录号为KJ867514。系统进化树分析发现,麦洼牦牛RGS5氨基酸序列与普通牛亲缘关系最近,其次是山羊和绵羊。RGS5基因编码的蛋白质分子质量为20.94ku,理论等电点(PI)为6.35,它是一种以α-螺旋为主,不含信号肽的非跨膜、不稳定性蛋白。三级结构预测显示,麦洼牦牛与人RGS5蛋白三级结构相似性高达90.51%。以上结果为深入研究RGS蛋白功能积累科学资料。

英文摘要:

Regulator of G protein signaling 5was cloned and analyzed by RT-PCR and bioinformatic methods.Phylogenetic tree was constructed using ClustalX 1.83 and Mega 5.0.The results showed that the sequence of RGS5 was 863bp and contained an open reading frame of 546 bp,which encoded 181 amino acids.Phylogenetic tree indicated that amino acids of RGS5 in Maiwa yak had high homology with cattle.The molecular mass of RGS5 protein was 20.94 ku and the theoretical PI was 6.35.The RGS5 was an unstable protein.It mainly contained helix with no signal peptide and transmembrane domain.Tertiary structure of RGS5 protein of Maiwa yak had similar tertiary structure with human RGS5 protein.It would be benefit for further study on function of RGS in Maiwa yak.

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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619