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牦牛G蛋白信号转导调节因子2克隆及序列分析
  • ISSN号:1004-7034
  • 期刊名称:黑龙江畜牧兽医
  • 时间:2015
  • 页码:18-21
  • 分类:S823.85[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医] Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]西南民族大学动物遗传育种学国家民委一教育部重点实验室,成都610041
  • 相关基金:中央高校基本科研业务费专项资金项目(2014NZ YQN45);国家民委牦牛遗传资源保护与利用创新团队项目;国家自然科学基金项目(31172198);西南民族大学研究生学位点建设项目(2013XWD-S071007)
  • 相关项目:牦牛乳腺泌乳启动期基因表达谱及初乳期优质基因筛选
中文摘要:

为了初步探讨牦牛RGs2基因的结构和功能,试验采用RT—PCR方法及TA克隆法得到麦洼牦牛RGS2基因,并运用不同的生物信息学软件对序列进行分析。结果表明:牦牛RGS2基因系列含1个540bp的开放阅读框,共编码178个氨基酸,GenBank数据库中登录号为FJ786041。编码Phe的密码子UUU、编码Leu的密码子UUG、编码IIe的密码子AUU等20种密码子为该基因的偏好性密码子,确定的27种最优密码子均以G或c结尾。RGS2氨基酸序列与普通牛、绵羊、山羊相似性分别为99.5%、96.3%、96.1%。系统发育树上,牦牛与普通牛聚在一起,亲缘关系最近。

英文摘要:

To preliminarily study the structure and function of yak RGS2 gene, the RGS2 gene in Maiwa yak was obtained by the methods of RT - PCR and TA cloning. The RGS2 gene sequence was analyzed with various bioinformatics softwares. The results showed that the RGS2 gene sequence in Maiwa yak contained an open reading frame (ORF) of 540 bp, encoding for a protein of 178 amino acids. Its accession num- ber in GenBank database was FJ786041. Codon preference analysis showed that the codon UUU in the encoding Phe, codon UUG in the enco- ding Leu, eodon AUU in the encoding He, and other 20 kinds of codons were the preference codons for the RGS2 gene. The endings of 27 kinds of the determined optimal codons were in C or G. The similarities of RGS2 amino sequence in the Maiwa yak with Bos taurus, Ovis aries, and Capra hireus were determined as 99.5%, 96.3%, and 96.1%, respectively. Phylogenetic analysis indicated that Bos grunniens gathered to- gether with Bos taurus, :there was a closest genetic relationship between them.

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期刊信息
  • 《黑龙江畜牧兽医》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:黑龙江省畜牧局
  • 主办单位:黑龙江省畜牧兽医学会 黑龙江省畜牧局
  • 主编:
  • 地址:哈尔滨市香坊区哈平路243号
  • 邮编:150069
  • 邮箱:hljxmsy@163.com
  • 电话:0451-82365922
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-7034
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1205/S
  • 邮发代号:14-28
  • 获奖情况:
  • 中国核心期刊,全国优秀科技期刊,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18993