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DNA甲基化与肥胖相关性的孟德尔随机化研究
  • ISSN号:0253-9624
  • 期刊名称:《中华预防医学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R730.231[医药卫生—肿瘤;医药卫生—临床医学]
  • 作者机构:[1]北京大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系,100191, [2]青岛市疾病预防控制中心办公室, [3]浙江省疾病预防控制中心办公室, [4]江苏省卫生和计划生育委员会卫生应急办公室, [5]四川省疾病预防控制中心办公室, [6]哈佛大学公共卫生学院流行病系
  • 相关基金:公益性行业科研专项(201502006,201002007);教育部科学技术研究重大项目(310006);自然科学基金项目(81473041)
中文摘要:

目的利用孟德尔随机化方法,探索DNA甲基化位点与肥胖的相关性。方法2013年以中国双生子登记系统中山东、江苏、浙江和四川招募的双生子人群中≥18岁的肥胖状况不一致的双生子作为本次调查对象,共469名。通过问卷调查、体格检查及血样采集,收集双生子的一般信息、行为信息及体格信息,并提取外周血DNA进行相关基因型测定及全基因组甲基化检测。并分析了全基因组DNA甲基化与BMI的关联以及CpGs与邻近SNP的关联。利用孟德尔随机化方法,以SNP位点r8748212作为工具,分析肥胖指标BMI与cg15053022甲基化的关系。结果研究共纳人469名调查对象,年龄为(44.8±13.2)岁,BMI为(25.0±3.8)kg/m^2。全基因组DNA甲基化与BMI的关联分析发现,有9个CpG位点甲基化水平与BMI存在关联。在进行CpGs甲基化与邻近SNP的关联分析发现,ATP4A基因的cg15053022与rs748212呈负相关(β=-0.020),rs748212AA、AC、CC基因型的cg15053022甲基化水平分别为0.212±0.025、0.242±0.024、0.264±0.028。孟德尔随机化分析发现,rs748212与BMI存在关联(β=0.04,P=0.007),且与ATP4A基因的cg15053022关联强度较高(F=237.66,P=0.143)。孟德尔随机化结果显示,cg15053022甲基化水平每降低10%,BMI增加0.197kg/m^2(8—1.97,P〈0.001)。结论本研究利用孟德尔随机化的方法发现观察性研究中ATP4A基因上的甲基化位点cg15053022甲基化能够影响BMI,为肥胖甲基化孟德尔随机化相关研究的方法学提供了参考依据。

英文摘要:

Objective To explore the association between DNA methylation and body mass index (BMI) using Mendelian randomization analysis. Methods A total of 469 participants were selected from the Chinese National Twin Registry in 2013, who were living in Shandong, Jiangsu, Zhejiang, and Sichuan provinces, and at least 18 years of age. A questionnaire survey and physical examination were conducted to collect demographic, clinical, and behavioral information. Peripheral blood cells were collected to detect genotype and methylation status. Association analyses between DNA methylation and BMI and between CpGs and cis-SNP were conducted. With rs748212 as the instrumental variable, the association between cg15053022 and BMI was explored using the Mendelian randomization method. Results A total of 469 participants were selected. The mean age of participants was (44.8±13.2) years and the BMI was (25.0±3.8) kg/m^2. Nine BMI-related DNA methylation sites were found and DNA methylation site cg15053022 in the ATP4A gene was negatively associated with cis-SNP rs748212 (β=-0.020); the mean methylation level of AA, AC, and CC were 0.212 ± 0.025, 0.242 ± 0.024, and 0.264 ± 0.028, respectively, rs748212 was associated with BMI (β=0.04, P=0.007) and closely related to cg15053022 (F=237.66, P=0.143). Mendelian randomization analysis showed lower methylation levels at cg15053022 were associated with higher BMI (β =- 1.97, P〈0.001). Conclusion This study supported the impact of cg15053022 methylation in the ATP4A gene on BMI using Mendelian randomization analysis and provided the basis for using Mendelian randomization analysis in methylation studies.

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期刊信息
  • 《中华预防医学杂志》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:北京市东四西大街42号
  • 邮编:100710
  • 邮箱:cjpm@cma.org.cn
  • 电话:010-85158262
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-9624
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2150/R
  • 邮发代号:2-61
  • 获奖情况:
  • 获中华医学会华瑞杯编辑规范奖,中华医学会优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:31250