位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
玉米Rubisco活化酶基因ZmRCA1的序列变异分析
  • ISSN号:0496-3490
  • 期刊名称:《作物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S511.01[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]广西大学农学院,广西南宁530005, [2]广西农业科学院玉米研究所,广西南宁530227, [3]中国农业科学院作物科学研究所,北京100081
  • 相关基金:国家重点基础研究发展计划(973计划)项目(2011CB100100 2009CB118401); 国家高技术研究发展计划(863计划)项目(2006AA10Z188)资助
中文摘要:

Rubisco活化酶(RCA)是一种可激活光合作用关键酶Rubisco的伴侣蛋白,可通过对Rubisco的活性调节决定植物的碳同化效率。为了研究玉米ZmRCA1的多态性,参考GenBank中编码玉米Rubisco活化酶的ZmRCA1基因组序列设计引物对玉米微核心种质的95份自交系的ZmRCA1进行测序,获得长约1 680 bp的基因组序列。多态分析表明,在1 680 bp的区间内共发现22个SNP和8个InDel,其中5个SNP和1个InDel变异产生氨基酸序列改变;频率在0.1以上的13个多态性位点共形成27种单倍型,利用6个多态性位点就可以分辨约90%的单倍型。ZmRCA1基因具有高度序列保守性,基因DNA序列相似性为97.9%,而氨基酸序列的相似性则达99.8%;中性检验表明,ZmRCA1基因符合中性进化模型假设,没有发生纯化选择。

英文摘要:

Rubisco is a pivotal enzyme that initiates the first step of carbon fixation and photorespiration in plant photosynthesis.Rubisco accounts for up to half of the soluble protein in the leaves of plants.Nevertheless,the catalytic rate of Rubisco is com-paratively low.Rubisco activity is regulated mainly by Rubisco activase,which serves as a molecular chaperone.By activating and regulating Rubisco,RCA potentially influences the efficiency of carbon assimilation in plants.Thereby,RCA has identified a possible target gene for improve production in crops breeding.To investigate polymorphism of ZmRCA1,sequened and analyzed the genomic sequences of ZmRCA1 from a minicore set of 95 maize inbred lines.Totally 22 SNPs and 8 InDels were identified in a 1 680 bp sequence alignment.There were five SNPs and one InDel,which generated amino acid sequence variation.A total of 27 haplotypes were identified with 13 polymorphic loci with the frequency of 0.1 or more.Approximately 90% haplotypes could be distinctly distinguished by six polymorphic loci.The ZmRCA1 gene was highly conserved,with the genic similarity of 97.9% and the amino acid sequence similarity of 99.8%.Neutrality tests showed that no purifying selection occurred in ZmRCA1.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《作物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国作物学会 中国农业科学院作物科学研究所
  • 主编:万建民
  • 地址:北京海淀区中关村南大街12号中国农业科学院
  • 邮编:100081
  • 邮箱:zwxb301@caas.cn
  • 电话:010-82108548
  • 国际标准刊号:ISSN:0496-3490
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1809/S
  • 邮发代号:82-336
  • 获奖情况:
  • 2002年-第三届中国科协优秀科技期刊二等奖,2002-2009年-百种中国杰出学术期刊,2004年获“全国优秀期刊一等奖”,2005年获第三届国家期刊奖提名奖,2009年评为“2008年度中国精品科技期刊”,2009年被评为“新中国60年有影响力的期刊”,2011年获"第二届中国出版政府奖期刊奖提名奖"
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国食品科技文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:49369