中国与吉尔吉斯斯坦建交20年来,两国在政治、经济、文化、人道主义救援及安全等领域开展了良好的互利合作,特别是近年来,中吉两国在多领域展开了务实合作,经贸、交通、能源、采矿、铁路、基础设施建设等领域合作项目不断增多。在2003年至2011年9年间,中国(新疆)对吉尔吉斯斯坦资本流出均大于其资本流入,呈现出中国(新疆)对吉尔吉斯斯坦资本流动为逆差、中国(新疆)对吉尔吉斯斯坦资本流出是中亚五国中规模最大的国家的特点。相对而言,吉尔吉斯斯坦对中国(新疆)的资本流入规模就非常小,仅为中亚五国对中国(新疆)的资本流入的8%不到。