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基于蛋白质-DNA复合物晶体结构的DNA结构动力学特性研究
  • ISSN号:1000-6737
  • 期刊名称:《生物物理学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q617[生物学—生物物理学]
  • 作者机构:[1]内蒙古科技大学理学院,包头014010, [2]内蒙古科技大学生物与化学工程学院,包头014010
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30460038).内蒙古自然科学基金重点项目(200508010102),内蒙古高等学校科学基金资助课题(NJ02116)
中文摘要:

依据最新NDB数据库中蛋白质-DNA复合物晶体结构数据,考虑DNA结构的序列依赖特性,对10个二联体和36个约化的四联体计算了DNA动力学结构模型中的关键参数——力常数矩阵,矩阵中的非对角项反映了结构参数间的关联。利用改进的DNA结构动力学模型,可以方便地计算给定序列的结构动力学特性。

英文摘要:

Based on protein-DNA complex crystal structural data in up-to-date Nucleic Acid Database, taking into account the sequence-dependent feature of DNA, the key parameters in DNA dynamic structural model, force constant matrix, were calculated for 10 dimers and 36 tetramers. The non-diagonal elements represent the correlation between the structural parameters. One can calculate structural features, for example, curvature and flexibility, for given sequence using improved dynamic structural model.

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期刊论文 15 会议论文 3 获奖 1 著作 1
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期刊信息
  • 《生物物理学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国生物物理学会
  • 主编:沈恂
  • 地址:北京朝阳区大屯路15号生物物理研究所内
  • 邮编:100101
  • 邮箱:acta@sun5.ibp.ac.cn
  • 电话:010-64888458
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-6737
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1992/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 二次获得中国科协优秀科技期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:7189