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NLGN3基因多态性与秦巴山区儿童精神发育迟滞的相关性
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q384[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]西北大学生命科学学院人口与健康研究所,西安710069, [2]西北大学公共管理学院应用心理学研究所,西安710127
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(编号:31340028,31100899,31371327); 教育部人文社会科学项目(编号:13YJCZH081)共同资助
中文摘要:

用来自中国秦巴山区的187例非特异性精神发育迟滞(NSMR)儿童及213例正常对照儿童组成病例对照样本,采用PCR-SSCP结合测序方法,对NLGN3基因上的6个SNP标记位点进行分型,采用关联分析法分析位点多态性与NSMR的关系,进而探讨NLGN3基因多态性与当地NSMR的相关性。单位点分析结果显示rs11795613位点的等位基因频率与基因型频率在NSMR与对照组间均存在显著性差异(p值分别为0.000 9,0.006),其它5个标记均未有显著性差异(p〉0.05)。单倍型分析表明,rs5981077-rs11795613组成的单倍型和秦巴山区NSMR显著相关(p=0.0004),与单位点分析结果一致。由此推断,NLGN3基因多态性与秦巴山区儿童NSMR有关,在该基因的rs11795613位点以及rs5981077-rs11795613单倍型块所标记的染色体区段中,可能存在着致病突变位点。

英文摘要:

The experimental samples including 187 NSMR cases and 213 normal children as matched controls were recruited from Qinba region in this study, to genotype 6 SNP loci in NLGN3 gene by using PCR-SSCP and DNA sequencing. To investigate the possible genetic association between NLGN3 gene and non-specific mental retardation(NSMR) of Qinba region. The results based on unit point analysis showed that the allele frequency and genotype frequency of the rs11795613 had significant difference between NSMR and the control group(p value was 0.000 9, 0.006), and the other 5 markers had no significant difference in the two groups(p〉0.05). Haplotype analysis showed that rs5981077-rs11795613 haplotype block was positively associated with NSMR in Qinba region(p=0.000 4), which was consistent with the unit point analysis. Our results suggested thatNLGN3 should be significantly associated with NSMR in Qinba region. There may be causative mutation sites near the chromosome segments marked by rs11795613 locus and rs5981077-rs11795613 haplotype block.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299