精神发育迟滞(MR)是一种常见的神经、精神类疾病,根据患者表型可分为特异性MR和非特异性MR两类,其中X连锁型非特异性MR(XLMR)的发病率约为1/1000。MR具有坚实的遗传学基础,研究表明约2/3的患者是由遗传因素所导致。前期研究提示X染色体的Xq12-Xq23区域与我国秦巴山区的MR儿童相关。但由于对染色体某一区段所含基因进行筛选和突变检测具有难度,因此利用我国人口资源发现和报道的MR相关基因并不多见。本项目拟在前期研究工作的基础上,以Xq12-X23作为候选区域,利用生物信息学网络资源进行数据挖掘,对该区域的基因进行筛选与优势度分析,确定MR候选基因,然后应用高分辨率熔解曲线(HRM)和单链构象多态性(SSCP)与测序相结合的方法,对目标基因进行突变检测,分析其突变类型及功能变化,从而搜寻出位于Xq12-Xq23区域的MR基因。
mental retardation;mutation detection;candidate gene;;
前期研究认为Xq12-Xq23区域参与我国秦巴山区非特异性精神发育迟滞(NSMR)形成,但尚未发现相关基因或突变。本课题应用MassARRAY芯片、PCR-SSCP、DNA测序等技术,结合家系人群样本和病例-对照样本,对该区域与秦巴山区NSMR的关系进行了研究。结果显示①利用SNP标记对整个Xq12-Xq23进行扫描,在rs3125999——rs5974392所标出的区段检测出强烈关联信号,提示其附近的LOC101928437基因及AMOT基因可能是秦巴山区MR的新的候选基因;②对目标区域已知MR基因进行检测,发现NLGN3基因与当地MR显著关联;在SRPX2基因中发现2处新的突变,可能导致患者智力低下;③由于MR具有高度遗传异质性,为了多角度探索其分子遗传机制,对目标区域以外的一些功能候选基因进行检测,发现PRSS12基因与MR关联;④对其他MR候选基因的检测未发现显著相关性。本研究初步锁定了Xq12-Xq23区域中参与秦巴山区NSMR发病的危险遗传因子,是对前期研究成果的延伸和深化,也为后续工作奠定了基础,通过未来对LOC101928437基因、AMOT基因遗传变异与NSMR形成的关系以及两者在此过程中的相互关系的研究,将使我们更加深刻地理解NSMR患者的病因及其形成机理,为秦巴山区MR病因研究与综合防治的庞大课题提供新的思路和理论支持。